Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syde1Q9DBZ9 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syde1Q9DBZ9 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syde1Q9DBZ9 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syde1Q9DBZ9 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syde1Q9DBZ9 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syde1Q9DBZ9 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Syde1Q9DBZ9 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syde1Q9DBZ9 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syde1Q9DBZ9 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Syde1Q9DBZ9 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syde1Q9DBZ9 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syde1Q9DBZ9 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syde1Q9DBZ9 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syde1Q9DBZ9 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Syde1Q9DBZ9 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syde1Q9DBZ9 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syde1Q9DBZ9 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syde1Q9DBZ9 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syde1Q9DBZ9 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syde1Q9DBZ9 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syde1Q9DBZ9 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syde1Q9DBZ9 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syde1Q9DBZ9 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syde1Q9DBZ9 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syde1Q9DBZ9 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syde1Q9DBZ9 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syde1Q9DBZ9 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syde1Q9DBZ9 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syde1Q9DBZ9 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syde1Q9DBZ9 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syde1Q9DBZ9 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Syde1Q9DBZ9 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syde1Q9DBZ9 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syde1Q9DBZ9 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syde1Q9DBZ9 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syde1Q9DBZ9 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syde1Q9DBZ9 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syde1Q9DBZ9 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syde1Q9DBZ9 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syde1Q9DBZ9 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syde1Q9DBZ9 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Syde1Q9DBZ9 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syde1Q9DBZ9 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syde1Q9DBZ9 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Syde1Q9DBZ9 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syde1Q9DBZ9 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syde1Q9DBZ9 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Syde1Q9DBZ9 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Syde1Q9DBZ9 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syde1Q9DBZ9 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syde1Q9DBZ9 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syde1Q9DBZ9 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syde1Q9DBZ9 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syde1Q9DBZ9 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syde1Q9DBZ9 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syde1Q9DBZ9 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syde1Q9DBZ9 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syde1Q9DBZ9 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syde1Q9DBZ9 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syde1Q9DBZ9 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syde1Q9DBZ9 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syde1Q9DBZ9 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syde1Q9DBZ9 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syde1Q9DBZ9 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syde1Q9DBZ9 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syde1Q9DBZ9 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syde1Q9DBZ9 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syde1Q9DBZ9 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syde1Q9DBZ9 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syde1Q9DBZ9 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Syde1Q9DBZ9 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syde1Q9DBZ9 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syde1Q9DBZ9 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Syde1Q9DBZ9 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Syde1Q9DBZ9 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Syde1Q9DBZ9 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syde1Q9DBZ9 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syde1Q9DBZ9 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Syde1Q9DBZ9 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syde1Q9DBZ9 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syde1Q9DBZ9 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syde1Q9DBZ9 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syde1Q9DBZ9 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syde1Q9DBZ9 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syde1Q9DBZ9 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syde1Q9DBZ9 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syde1Q9DBZ9 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syde1Q9DBZ9 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syde1Q9DBZ9 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syde1Q9DBZ9 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syde1Q9DBZ9 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syde1Q9DBZ9 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syde1Q9DBZ9 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syde1Q9DBZ9 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syde1Q9DBZ9 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syde1Q9DBZ9 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syde1Q9DBZ9 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syde1Q9DBZ9 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Syde1Q9DBZ9 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms