Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnf6Q9DBU5 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnf6Q9DBU5 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnf6Q9DBU5 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnf6Q9DBU5 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnf6Q9DBU5 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnf6Q9DBU5 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Rnf6Q9DBU5 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnf6Q9DBU5 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnf6Q9DBU5 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnf6Q9DBU5 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnf6Q9DBU5 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnf6Q9DBU5 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnf6Q9DBU5 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnf6Q9DBU5 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
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Rnf6Q9DBU5 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnf6Q9DBU5 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Rnf6Q9DBU5 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Rnf6Q9DBU5 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
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Rnf6Q9DBU5 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnf6Q9DBU5 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnf6Q9DBU5 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnf6Q9DBU5 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnf6Q9DBU5 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnf6Q9DBU5 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnf6Q9DBU5 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnf6Q9DBU5 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnf6Q9DBU5 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rnf6Q9DBU5 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rnf6Q9DBU5 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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Rnf6Q9DBU5 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rnf6Q9DBU5 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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Rnf6Q9DBU5 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rnf6Q9DBU5 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rnf6Q9DBU5 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rnf6Q9DBU5 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rnf6Q9DBU5 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rnf6Q9DBU5 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Rnf6Q9DBU5 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Rnf6Q9DBU5 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Rnf6Q9DBU5 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rnf6Q9DBU5 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rnf6Q9DBU5 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rnf6Q9DBU5 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
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