Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU3

Riok3, Serine/threonine-protein kinase RIO3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 519 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok3Q9DBU3 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Riok3Q9DBU3 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Riok3Q9DBU3 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Riok3Q9DBU3 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Riok3Q9DBU3 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Riok3Q9DBU3 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Riok3Q9DBU3 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Riok3Q9DBU3 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Riok3Q9DBU3 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Riok3Q9DBU3 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Riok3Q9DBU3 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Riok3Q9DBU3 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Riok3Q9DBU3 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Riok3Q9DBU3 Ociad2-206ENSMUST00000202012 876 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Riok3Q9DBU3 Gm45554-202ENSMUST00000210964 1090 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Riok3Q9DBU3 Vmn1r16-201ENSMUST00000227168 912 ntAPPRIS P2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Riok3Q9DBU3 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Riok3Q9DBU3 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Riok3Q9DBU3 Prl8a9-201ENSMUST00000006662 942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Riok3Q9DBU3 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Riok3Q9DBU3 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Riok3Q9DBU3 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Riok3Q9DBU3 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Riok3Q9DBU3 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Riok3Q9DBU3 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Riok3Q9DBU3 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Riok3Q9DBU3 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Riok3Q9DBU3 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Riok3Q9DBU3 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Riok3Q9DBU3 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Riok3Q9DBU3 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Riok3Q9DBU3 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Riok3Q9DBU3 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Riok3Q9DBU3 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Riok3Q9DBU3 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Riok3Q9DBU3 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Riok3Q9DBU3 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Riok3Q9DBU3 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Riok3Q9DBU3 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Riok3Q9DBU3 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Riok3Q9DBU3 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Riok3Q9DBU3 Gm15346-201ENSMUST00000143638 475 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Riok3Q9DBU3 Gm4141-201ENSMUST00000174364 921 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Riok3Q9DBU3 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Riok3Q9DBU3 Gm4201-201ENSMUST00000174775 921 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Riok3Q9DBU3 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Riok3Q9DBU3 Tceanc-203ENSMUST00000180322 1080 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Riok3Q9DBU3 Gm18752-202ENSMUST00000193627 587 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Riok3Q9DBU3 Gm37490-201ENSMUST00000195566 724 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Riok3Q9DBU3 Gm43177-201ENSMUST00000197032 1107 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Riok3Q9DBU3 1700113A16Rik-203ENSMUST00000200006 563 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Riok3Q9DBU3 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Riok3Q9DBU3 Akr1c13-201ENSMUST00000021634 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Riok3Q9DBU3 AC159297.2-201ENSMUST00000219567 1075 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Riok3Q9DBU3 4930480M12Rik-201ENSMUST00000221084 550 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Riok3Q9DBU3 Gm36525-201ENSMUST00000222590 638 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Riok3Q9DBU3 AC133517.2-201ENSMUST00000226820 690 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Riok3Q9DBU3 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Riok3Q9DBU3 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Riok3Q9DBU3 Spink12-201ENSMUST00000081271 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Riok3Q9DBU3 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Riok3Q9DBU3 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Riok3Q9DBU3 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Riok3Q9DBU3 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Riok3Q9DBU3 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Riok3Q9DBU3 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Riok3Q9DBU3 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Riok3Q9DBU3 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Riok3Q9DBU3 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Riok3Q9DBU3 Olfr183-204ENSMUST00000214831 1906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Riok3Q9DBU3 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Riok3Q9DBU3 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Riok3Q9DBU3 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Riok3Q9DBU3 Olfr23-202ENSMUST00000214210 2527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Riok3Q9DBU3 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Riok3Q9DBU3 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Riok3Q9DBU3 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Riok3Q9DBU3 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Riok3Q9DBU3 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Riok3Q9DBU3 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Riok3Q9DBU3 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Riok3Q9DBU3 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Riok3Q9DBU3 Gm10375-201ENSMUST00000100692 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Riok3Q9DBU3 Gm10377-201ENSMUST00000100695 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Riok3Q9DBU3 Mir669l-201ENSMUST00000103771 98 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Riok3Q9DBU3 Gm3543-201ENSMUST00000111870 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Riok3Q9DBU3 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Riok3Q9DBU3 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Riok3Q9DBU3 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Riok3Q9DBU3 1700001F09Rik-201ENSMUST00000178178 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Riok3Q9DBU3 Gm43894-201ENSMUST00000203274 688 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Riok3Q9DBU3 Gm44332-201ENSMUST00000203712 433 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Riok3Q9DBU3 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Riok3Q9DBU3 4933402C06Rik-203ENSMUST00000207559 1227 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Riok3Q9DBU3 Gm33501-201ENSMUST00000209257 1193 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Riok3Q9DBU3 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Riok3Q9DBU3 AC161453.1-201ENSMUST00000226078 884 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Riok3Q9DBU3 Med21-201ENSMUST00000032429 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Riok3Q9DBU3 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Riok3Q9DBU3 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
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