Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBQ9

Swt1, Transcriptional protein SWT1, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Swt1Q9DBQ9 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Swt1Q9DBQ9 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Swt1Q9DBQ9 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Swt1Q9DBQ9 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Swt1Q9DBQ9 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Swt1Q9DBQ9 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Swt1Q9DBQ9 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Swt1Q9DBQ9 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Swt1Q9DBQ9 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Swt1Q9DBQ9 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Swt1Q9DBQ9 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Swt1Q9DBQ9 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Swt1Q9DBQ9 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Swt1Q9DBQ9 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Swt1Q9DBQ9 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Swt1Q9DBQ9 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Swt1Q9DBQ9 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Swt1Q9DBQ9 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Swt1Q9DBQ9 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Swt1Q9DBQ9 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Swt1Q9DBQ9 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Swt1Q9DBQ9 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Swt1Q9DBQ9 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Swt1Q9DBQ9 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Swt1Q9DBQ9 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Swt1Q9DBQ9 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Swt1Q9DBQ9 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Swt1Q9DBQ9 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Swt1Q9DBQ9 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Swt1Q9DBQ9 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Swt1Q9DBQ9 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Swt1Q9DBQ9 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Swt1Q9DBQ9 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Swt1Q9DBQ9 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Swt1Q9DBQ9 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Swt1Q9DBQ9 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Swt1Q9DBQ9 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Swt1Q9DBQ9 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Swt1Q9DBQ9 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Swt1Q9DBQ9 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Swt1Q9DBQ9 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Swt1Q9DBQ9 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Swt1Q9DBQ9 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Swt1Q9DBQ9 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Swt1Q9DBQ9 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Swt1Q9DBQ9 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Swt1Q9DBQ9 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Swt1Q9DBQ9 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Swt1Q9DBQ9 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Swt1Q9DBQ9 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Swt1Q9DBQ9 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Swt1Q9DBQ9 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Swt1Q9DBQ9 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Swt1Q9DBQ9 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Swt1Q9DBQ9 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Swt1Q9DBQ9 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Swt1Q9DBQ9 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Swt1Q9DBQ9 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Swt1Q9DBQ9 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Swt1Q9DBQ9 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Swt1Q9DBQ9 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Swt1Q9DBQ9 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Swt1Q9DBQ9 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Swt1Q9DBQ9 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Swt1Q9DBQ9 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Swt1Q9DBQ9 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Swt1Q9DBQ9 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Swt1Q9DBQ9 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Swt1Q9DBQ9 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Swt1Q9DBQ9 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Swt1Q9DBQ9 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Swt1Q9DBQ9 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Swt1Q9DBQ9 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Swt1Q9DBQ9 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Swt1Q9DBQ9 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Swt1Q9DBQ9 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Swt1Q9DBQ9 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Swt1Q9DBQ9 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Swt1Q9DBQ9 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Swt1Q9DBQ9 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Swt1Q9DBQ9 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Swt1Q9DBQ9 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Swt1Q9DBQ9 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Swt1Q9DBQ9 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Swt1Q9DBQ9 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Swt1Q9DBQ9 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Swt1Q9DBQ9 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Swt1Q9DBQ9 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Swt1Q9DBQ9 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Swt1Q9DBQ9 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Swt1Q9DBQ9 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Swt1Q9DBQ9 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Swt1Q9DBQ9 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Swt1Q9DBQ9 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Swt1Q9DBQ9 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Swt1Q9DBQ9 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Swt1Q9DBQ9 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Swt1Q9DBQ9 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Swt1Q9DBQ9 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Swt1Q9DBQ9 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms