Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB70

Fundc1, FUN14 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fundc1Q9DB70 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Fundc1Q9DB70 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fundc1Q9DB70 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fundc1Q9DB70 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fundc1Q9DB70 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fundc1Q9DB70 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fundc1Q9DB70 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fundc1Q9DB70 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fundc1Q9DB70 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fundc1Q9DB70 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fundc1Q9DB70 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Fundc1Q9DB70 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fundc1Q9DB70 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fundc1Q9DB70 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Fundc1Q9DB70 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fundc1Q9DB70 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fundc1Q9DB70 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fundc1Q9DB70 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fundc1Q9DB70 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fundc1Q9DB70 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fundc1Q9DB70 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fundc1Q9DB70 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fundc1Q9DB70 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fundc1Q9DB70 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fundc1Q9DB70 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fundc1Q9DB70 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fundc1Q9DB70 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fundc1Q9DB70 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fundc1Q9DB70 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fundc1Q9DB70 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fundc1Q9DB70 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fundc1Q9DB70 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fundc1Q9DB70 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fundc1Q9DB70 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fundc1Q9DB70 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fundc1Q9DB70 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fundc1Q9DB70 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fundc1Q9DB70 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fundc1Q9DB70 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fundc1Q9DB70 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fundc1Q9DB70 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fundc1Q9DB70 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fundc1Q9DB70 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fundc1Q9DB70 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fundc1Q9DB70 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fundc1Q9DB70 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fundc1Q9DB70 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fundc1Q9DB70 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fundc1Q9DB70 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fundc1Q9DB70 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fundc1Q9DB70 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fundc1Q9DB70 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fundc1Q9DB70 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fundc1Q9DB70 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fundc1Q9DB70 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fundc1Q9DB70 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fundc1Q9DB70 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fundc1Q9DB70 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fundc1Q9DB70 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fundc1Q9DB70 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fundc1Q9DB70 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fundc1Q9DB70 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fundc1Q9DB70 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fundc1Q9DB70 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fundc1Q9DB70 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fundc1Q9DB70 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fundc1Q9DB70 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fundc1Q9DB70 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Fundc1Q9DB70 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Fundc1Q9DB70 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fundc1Q9DB70 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fundc1Q9DB70 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fundc1Q9DB70 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fundc1Q9DB70 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fundc1Q9DB70 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fundc1Q9DB70 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fundc1Q9DB70 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fundc1Q9DB70 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fundc1Q9DB70 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fundc1Q9DB70 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fundc1Q9DB70 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fundc1Q9DB70 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fundc1Q9DB70 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fundc1Q9DB70 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fundc1Q9DB70 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fundc1Q9DB70 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fundc1Q9DB70 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fundc1Q9DB70 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Fundc1Q9DB70 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fundc1Q9DB70 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fundc1Q9DB70 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fundc1Q9DB70 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fundc1Q9DB70 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fundc1Q9DB70 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fundc1Q9DB70 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fundc1Q9DB70 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fundc1Q9DB70 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Fundc1Q9DB70 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fundc1Q9DB70 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fundc1Q9DB70 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms