Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB38

Znf580, Zinc finger protein 580, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf580Q9DB38 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Znf580Q9DB38 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Znf580Q9DB38 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Znf580Q9DB38 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Znf580Q9DB38 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Znf580Q9DB38 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Znf580Q9DB38 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Znf580Q9DB38 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Znf580Q9DB38 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Znf580Q9DB38 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Znf580Q9DB38 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Znf580Q9DB38 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Znf580Q9DB38 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Znf580Q9DB38 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Znf580Q9DB38 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Znf580Q9DB38 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Znf580Q9DB38 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Znf580Q9DB38 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Znf580Q9DB38 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Znf580Q9DB38 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Znf580Q9DB38 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Znf580Q9DB38 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Znf580Q9DB38 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Znf580Q9DB38 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Znf580Q9DB38 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Znf580Q9DB38 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Znf580Q9DB38 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Znf580Q9DB38 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Znf580Q9DB38 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Znf580Q9DB38 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Znf580Q9DB38 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Znf580Q9DB38 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Znf580Q9DB38 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Znf580Q9DB38 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Znf580Q9DB38 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Znf580Q9DB38 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Znf580Q9DB38 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Znf580Q9DB38 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Znf580Q9DB38 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Znf580Q9DB38 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Znf580Q9DB38 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Znf580Q9DB38 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Znf580Q9DB38 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Znf580Q9DB38 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Znf580Q9DB38 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Znf580Q9DB38 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Znf580Q9DB38 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Znf580Q9DB38 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Znf580Q9DB38 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Znf580Q9DB38 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Znf580Q9DB38 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Znf580Q9DB38 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Znf580Q9DB38 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Znf580Q9DB38 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Znf580Q9DB38 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Znf580Q9DB38 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Znf580Q9DB38 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Znf580Q9DB38 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Znf580Q9DB38 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Znf580Q9DB38 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Znf580Q9DB38 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Znf580Q9DB38 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Znf580Q9DB38 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Znf580Q9DB38 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Znf580Q9DB38 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Znf580Q9DB38 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Znf580Q9DB38 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Znf580Q9DB38 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Znf580Q9DB38 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Znf580Q9DB38 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Znf580Q9DB38 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Znf580Q9DB38 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Znf580Q9DB38 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Znf580Q9DB38 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Znf580Q9DB38 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Znf580Q9DB38 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Znf580Q9DB38 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Znf580Q9DB38 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Znf580Q9DB38 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Znf580Q9DB38 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Znf580Q9DB38 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Znf580Q9DB38 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Znf580Q9DB38 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Znf580Q9DB38 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Znf580Q9DB38 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Znf580Q9DB38 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Znf580Q9DB38 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Znf580Q9DB38 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Znf580Q9DB38 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Znf580Q9DB38 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Znf580Q9DB38 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Znf580Q9DB38 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Znf580Q9DB38 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Znf580Q9DB38 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Znf580Q9DB38 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Znf580Q9DB38 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Znf580Q9DB38 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Znf580Q9DB38 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Znf580Q9DB38 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Znf580Q9DB38 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms