Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAU1

Cnpy3, Protein canopy homolog 3, mousemouse

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Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnpy3Q9DAU1 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cnpy3Q9DAU1 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Cnpy3Q9DAU1 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cnpy3Q9DAU1 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cnpy3Q9DAU1 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cnpy3Q9DAU1 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cnpy3Q9DAU1 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cnpy3Q9DAU1 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cnpy3Q9DAU1 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cnpy3Q9DAU1 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cnpy3Q9DAU1 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cnpy3Q9DAU1 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cnpy3Q9DAU1 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cnpy3Q9DAU1 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cnpy3Q9DAU1 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cnpy3Q9DAU1 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnpy3Q9DAU1 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnpy3Q9DAU1 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnpy3Q9DAU1 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnpy3Q9DAU1 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnpy3Q9DAU1 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnpy3Q9DAU1 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnpy3Q9DAU1 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnpy3Q9DAU1 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnpy3Q9DAU1 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnpy3Q9DAU1 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnpy3Q9DAU1 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnpy3Q9DAU1 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnpy3Q9DAU1 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnpy3Q9DAU1 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnpy3Q9DAU1 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnpy3Q9DAU1 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnpy3Q9DAU1 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnpy3Q9DAU1 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnpy3Q9DAU1 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnpy3Q9DAU1 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnpy3Q9DAU1 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnpy3Q9DAU1 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnpy3Q9DAU1 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnpy3Q9DAU1 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnpy3Q9DAU1 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnpy3Q9DAU1 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnpy3Q9DAU1 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnpy3Q9DAU1 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnpy3Q9DAU1 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cnpy3Q9DAU1 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cnpy3Q9DAU1 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cnpy3Q9DAU1 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cnpy3Q9DAU1 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cnpy3Q9DAU1 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cnpy3Q9DAU1 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cnpy3Q9DAU1 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cnpy3Q9DAU1 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Cnpy3Q9DAU1 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cnpy3Q9DAU1 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cnpy3Q9DAU1 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cnpy3Q9DAU1 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cnpy3Q9DAU1 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cnpy3Q9DAU1 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cnpy3Q9DAU1 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cnpy3Q9DAU1 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cnpy3Q9DAU1 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cnpy3Q9DAU1 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cnpy3Q9DAU1 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cnpy3Q9DAU1 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cnpy3Q9DAU1 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cnpy3Q9DAU1 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cnpy3Q9DAU1 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cnpy3Q9DAU1 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Cnpy3Q9DAU1 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cnpy3Q9DAU1 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cnpy3Q9DAU1 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Cnpy3Q9DAU1 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cnpy3Q9DAU1 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Cnpy3Q9DAU1 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cnpy3Q9DAU1 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cnpy3Q9DAU1 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cnpy3Q9DAU1 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cnpy3Q9DAU1 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cnpy3Q9DAU1 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cnpy3Q9DAU1 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cnpy3Q9DAU1 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Cnpy3Q9DAU1 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cnpy3Q9DAU1 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cnpy3Q9DAU1 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cnpy3Q9DAU1 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cnpy3Q9DAU1 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cnpy3Q9DAU1 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cnpy3Q9DAU1 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cnpy3Q9DAU1 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cnpy3Q9DAU1 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cnpy3Q9DAU1 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cnpy3Q9DAU1 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cnpy3Q9DAU1 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Cnpy3Q9DAU1 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Cnpy3Q9DAU1 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cnpy3Q9DAU1 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cnpy3Q9DAU1 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Cnpy3Q9DAU1 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cnpy3Q9DAU1 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms