Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA73

Ccdc89, Coiled-coil domain-containing protein 89, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc89Q9DA73 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc89Q9DA73 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc89Q9DA73 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc89Q9DA73 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc89Q9DA73 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc89Q9DA73 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc89Q9DA73 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc89Q9DA73 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc89Q9DA73 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc89Q9DA73 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc89Q9DA73 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc89Q9DA73 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc89Q9DA73 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc89Q9DA73 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc89Q9DA73 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc89Q9DA73 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc89Q9DA73 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc89Q9DA73 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc89Q9DA73 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc89Q9DA73 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc89Q9DA73 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc89Q9DA73 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc89Q9DA73 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc89Q9DA73 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc89Q9DA73 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc89Q9DA73 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc89Q9DA73 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc89Q9DA73 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc89Q9DA73 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc89Q9DA73 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc89Q9DA73 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc89Q9DA73 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc89Q9DA73 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc89Q9DA73 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc89Q9DA73 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc89Q9DA73 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc89Q9DA73 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc89Q9DA73 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc89Q9DA73 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc89Q9DA73 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc89Q9DA73 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc89Q9DA73 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc89Q9DA73 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc89Q9DA73 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc89Q9DA73 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc89Q9DA73 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc89Q9DA73 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc89Q9DA73 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc89Q9DA73 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc89Q9DA73 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc89Q9DA73 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc89Q9DA73 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc89Q9DA73 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc89Q9DA73 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc89Q9DA73 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc89Q9DA73 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc89Q9DA73 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc89Q9DA73 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc89Q9DA73 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc89Q9DA73 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc89Q9DA73 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc89Q9DA73 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc89Q9DA73 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc89Q9DA73 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc89Q9DA73 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc89Q9DA73 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc89Q9DA73 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc89Q9DA73 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc89Q9DA73 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc89Q9DA73 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc89Q9DA73 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc89Q9DA73 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc89Q9DA73 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc89Q9DA73 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc89Q9DA73 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc89Q9DA73 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc89Q9DA73 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc89Q9DA73 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc89Q9DA73 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc89Q9DA73 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc89Q9DA73 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc89Q9DA73 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc89Q9DA73 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc89Q9DA73 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc89Q9DA73 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc89Q9DA73 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc89Q9DA73 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc89Q9DA73 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc89Q9DA73 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc89Q9DA73 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc89Q9DA73 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc89Q9DA73 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc89Q9DA73 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc89Q9DA73 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc89Q9DA73 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc89Q9DA73 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc89Q9DA73 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc89Q9DA73 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc89Q9DA73 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc89Q9DA73 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms