Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M4

Pdzd9, PDZ domain-containing protein 9, mousemouse

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Length 266 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd9Q9D9M4 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
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Pdzd9Q9D9M4 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pdzd9Q9D9M4 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pdzd9Q9D9M4 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pdzd9Q9D9M4 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pdzd9Q9D9M4 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pdzd9Q9D9M4 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pdzd9Q9D9M4 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Pdzd9Q9D9M4 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pdzd9Q9D9M4 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pdzd9Q9D9M4 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pdzd9Q9D9M4 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pdzd9Q9D9M4 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pdzd9Q9D9M4 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pdzd9Q9D9M4 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pdzd9Q9D9M4 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pdzd9Q9D9M4 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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Pdzd9Q9D9M4 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pdzd9Q9D9M4 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pdzd9Q9D9M4 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pdzd9Q9D9M4 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pdzd9Q9D9M4 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pdzd9Q9D9M4 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pdzd9Q9D9M4 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pdzd9Q9D9M4 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
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Pdzd9Q9D9M4 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pdzd9Q9D9M4 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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Pdzd9Q9D9M4 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pdzd9Q9D9M4 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pdzd9Q9D9M4 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pdzd9Q9D9M4 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pdzd9Q9D9M4 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pdzd9Q9D9M4 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pdzd9Q9D9M4 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pdzd9Q9D9M4 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
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Pdzd9Q9D9M4 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pdzd9Q9D9M4 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pdzd9Q9D9M4 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pdzd9Q9D9M4 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pdzd9Q9D9M4 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
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Pdzd9Q9D9M4 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
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Pdzd9Q9D9M4 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pdzd9Q9D9M4 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pdzd9Q9D9M4 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pdzd9Q9D9M4 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
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Pdzd9Q9D9M4 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pdzd9Q9D9M4 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pdzd9Q9D9M4 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
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Pdzd9Q9D9M4 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pdzd9Q9D9M4 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
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Pdzd9Q9D9M4 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pdzd9Q9D9M4 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pdzd9Q9D9M4 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pdzd9Q9D9M4 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pdzd9Q9D9M4 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pdzd9Q9D9M4 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
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Pdzd9Q9D9M4 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Pdzd9Q9D9M4 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pdzd9Q9D9M4 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pdzd9Q9D9M4 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pdzd9Q9D9M4 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pdzd9Q9D9M4 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pdzd9Q9D9M4 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pdzd9Q9D9M4 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pdzd9Q9D9M4 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Pdzd9Q9D9M4 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pdzd9Q9D9M4 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pdzd9Q9D9M4 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Pdzd9Q9D9M4 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Pdzd9Q9D9M4 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Pdzd9Q9D9M4 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pdzd9Q9D9M4 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pdzd9Q9D9M4 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pdzd9Q9D9M4 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pdzd9Q9D9M4 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pdzd9Q9D9M4 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pdzd9Q9D9M4 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Pdzd9Q9D9M4 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Pdzd9Q9D9M4 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pdzd9Q9D9M4 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pdzd9Q9D9M4 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pdzd9Q9D9M4 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pdzd9Q9D9M4 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pdzd9Q9D9M4 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
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