Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp12Q9D9M2 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp12Q9D9M2 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp12Q9D9M2 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp12Q9D9M2 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp12Q9D9M2 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp12Q9D9M2 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp12Q9D9M2 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp12Q9D9M2 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp12Q9D9M2 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp12Q9D9M2 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp12Q9D9M2 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp12Q9D9M2 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp12Q9D9M2 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp12Q9D9M2 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp12Q9D9M2 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp12Q9D9M2 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp12Q9D9M2 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp12Q9D9M2 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp12Q9D9M2 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp12Q9D9M2 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp12Q9D9M2 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp12Q9D9M2 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp12Q9D9M2 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp12Q9D9M2 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp12Q9D9M2 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp12Q9D9M2 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp12Q9D9M2 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp12Q9D9M2 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp12Q9D9M2 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp12Q9D9M2 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp12Q9D9M2 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp12Q9D9M2 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp12Q9D9M2 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp12Q9D9M2 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp12Q9D9M2 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp12Q9D9M2 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp12Q9D9M2 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp12Q9D9M2 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp12Q9D9M2 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp12Q9D9M2 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp12Q9D9M2 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp12Q9D9M2 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp12Q9D9M2 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp12Q9D9M2 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp12Q9D9M2 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp12Q9D9M2 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp12Q9D9M2 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp12Q9D9M2 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp12Q9D9M2 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp12Q9D9M2 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp12Q9D9M2 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp12Q9D9M2 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp12Q9D9M2 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp12Q9D9M2 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp12Q9D9M2 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp12Q9D9M2 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp12Q9D9M2 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp12Q9D9M2 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp12Q9D9M2 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp12Q9D9M2 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp12Q9D9M2 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp12Q9D9M2 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp12Q9D9M2 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp12Q9D9M2 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp12Q9D9M2 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp12Q9D9M2 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp12Q9D9M2 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp12Q9D9M2 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp12Q9D9M2 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp12Q9D9M2 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp12Q9D9M2 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp12Q9D9M2 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp12Q9D9M2 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp12Q9D9M2 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp12Q9D9M2 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp12Q9D9M2 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp12Q9D9M2 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp12Q9D9M2 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp12Q9D9M2 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp12Q9D9M2 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp12Q9D9M2 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp12Q9D9M2 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp12Q9D9M2 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp12Q9D9M2 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp12Q9D9M2 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp12Q9D9M2 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp12Q9D9M2 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp12Q9D9M2 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp12Q9D9M2 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp12Q9D9M2 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp12Q9D9M2 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp12Q9D9M2 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp12Q9D9M2 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp12Q9D9M2 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp12Q9D9M2 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp12Q9D9M2 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp12Q9D9M2 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp12Q9D9M2 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp12Q9D9M2 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms