Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9J8

Bpifa3, BPI fold-containing family A member 3, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bpifa3Q9D9J8 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Bpifa3Q9D9J8 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Bpifa3Q9D9J8 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Bpifa3Q9D9J8 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Bpifa3Q9D9J8 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Bpifa3Q9D9J8 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Bpifa3Q9D9J8 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Bpifa3Q9D9J8 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Bpifa3Q9D9J8 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Bpifa3Q9D9J8 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Bpifa3Q9D9J8 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bpifa3Q9D9J8 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bpifa3Q9D9J8 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bpifa3Q9D9J8 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bpifa3Q9D9J8 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bpifa3Q9D9J8 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bpifa3Q9D9J8 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bpifa3Q9D9J8 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bpifa3Q9D9J8 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bpifa3Q9D9J8 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bpifa3Q9D9J8 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bpifa3Q9D9J8 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bpifa3Q9D9J8 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bpifa3Q9D9J8 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Bpifa3Q9D9J8 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bpifa3Q9D9J8 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bpifa3Q9D9J8 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bpifa3Q9D9J8 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bpifa3Q9D9J8 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bpifa3Q9D9J8 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bpifa3Q9D9J8 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bpifa3Q9D9J8 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bpifa3Q9D9J8 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bpifa3Q9D9J8 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bpifa3Q9D9J8 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bpifa3Q9D9J8 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bpifa3Q9D9J8 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bpifa3Q9D9J8 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bpifa3Q9D9J8 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bpifa3Q9D9J8 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bpifa3Q9D9J8 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bpifa3Q9D9J8 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Bpifa3Q9D9J8 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bpifa3Q9D9J8 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bpifa3Q9D9J8 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bpifa3Q9D9J8 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bpifa3Q9D9J8 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bpifa3Q9D9J8 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bpifa3Q9D9J8 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Bpifa3Q9D9J8 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bpifa3Q9D9J8 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bpifa3Q9D9J8 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bpifa3Q9D9J8 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bpifa3Q9D9J8 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bpifa3Q9D9J8 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bpifa3Q9D9J8 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bpifa3Q9D9J8 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bpifa3Q9D9J8 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Bpifa3Q9D9J8 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bpifa3Q9D9J8 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bpifa3Q9D9J8 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bpifa3Q9D9J8 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bpifa3Q9D9J8 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bpifa3Q9D9J8 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Bpifa3Q9D9J8 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bpifa3Q9D9J8 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bpifa3Q9D9J8 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Bpifa3Q9D9J8 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bpifa3Q9D9J8 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bpifa3Q9D9J8 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bpifa3Q9D9J8 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bpifa3Q9D9J8 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bpifa3Q9D9J8 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bpifa3Q9D9J8 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bpifa3Q9D9J8 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bpifa3Q9D9J8 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bpifa3Q9D9J8 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bpifa3Q9D9J8 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bpifa3Q9D9J8 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Bpifa3Q9D9J8 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bpifa3Q9D9J8 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bpifa3Q9D9J8 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bpifa3Q9D9J8 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bpifa3Q9D9J8 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bpifa3Q9D9J8 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bpifa3Q9D9J8 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bpifa3Q9D9J8 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bpifa3Q9D9J8 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bpifa3Q9D9J8 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bpifa3Q9D9J8 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bpifa3Q9D9J8 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bpifa3Q9D9J8 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bpifa3Q9D9J8 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Bpifa3Q9D9J8 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bpifa3Q9D9J8 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bpifa3Q9D9J8 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bpifa3Q9D9J8 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bpifa3Q9D9J8 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bpifa3Q9D9J8 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bpifa3Q9D9J8 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms