Protein–RNA interactions for Protein: Q9D995

Cntd1, Cyclin N-terminal domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntd1Q9D995 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cntd1Q9D995 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cntd1Q9D995 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cntd1Q9D995 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cntd1Q9D995 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cntd1Q9D995 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cntd1Q9D995 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Cntd1Q9D995 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cntd1Q9D995 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cntd1Q9D995 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cntd1Q9D995 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cntd1Q9D995 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cntd1Q9D995 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cntd1Q9D995 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cntd1Q9D995 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cntd1Q9D995 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cntd1Q9D995 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cntd1Q9D995 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cntd1Q9D995 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cntd1Q9D995 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cntd1Q9D995 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cntd1Q9D995 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cntd1Q9D995 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cntd1Q9D995 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cntd1Q9D995 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cntd1Q9D995 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cntd1Q9D995 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cntd1Q9D995 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cntd1Q9D995 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cntd1Q9D995 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cntd1Q9D995 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cntd1Q9D995 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cntd1Q9D995 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cntd1Q9D995 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cntd1Q9D995 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Cntd1Q9D995 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cntd1Q9D995 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cntd1Q9D995 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cntd1Q9D995 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cntd1Q9D995 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cntd1Q9D995 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cntd1Q9D995 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cntd1Q9D995 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cntd1Q9D995 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cntd1Q9D995 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cntd1Q9D995 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cntd1Q9D995 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cntd1Q9D995 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cntd1Q9D995 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cntd1Q9D995 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cntd1Q9D995 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cntd1Q9D995 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cntd1Q9D995 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cntd1Q9D995 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cntd1Q9D995 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Cntd1Q9D995 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cntd1Q9D995 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cntd1Q9D995 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cntd1Q9D995 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cntd1Q9D995 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Cntd1Q9D995 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Cntd1Q9D995 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cntd1Q9D995 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cntd1Q9D995 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cntd1Q9D995 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cntd1Q9D995 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cntd1Q9D995 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cntd1Q9D995 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cntd1Q9D995 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cntd1Q9D995 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cntd1Q9D995 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cntd1Q9D995 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cntd1Q9D995 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cntd1Q9D995 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cntd1Q9D995 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cntd1Q9D995 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cntd1Q9D995 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cntd1Q9D995 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cntd1Q9D995 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cntd1Q9D995 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cntd1Q9D995 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cntd1Q9D995 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cntd1Q9D995 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Cntd1Q9D995 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Cntd1Q9D995 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cntd1Q9D995 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cntd1Q9D995 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cntd1Q9D995 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cntd1Q9D995 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cntd1Q9D995 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cntd1Q9D995 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cntd1Q9D995 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cntd1Q9D995 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Cntd1Q9D995 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cntd1Q9D995 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cntd1Q9D995 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cntd1Q9D995 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cntd1Q9D995 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cntd1Q9D995 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cntd1Q9D995 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms