Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8X5

Cnot8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot8Q9D8X5 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnot8Q9D8X5 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnot8Q9D8X5 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnot8Q9D8X5 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnot8Q9D8X5 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnot8Q9D8X5 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnot8Q9D8X5 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnot8Q9D8X5 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnot8Q9D8X5 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnot8Q9D8X5 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnot8Q9D8X5 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnot8Q9D8X5 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnot8Q9D8X5 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnot8Q9D8X5 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnot8Q9D8X5 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnot8Q9D8X5 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnot8Q9D8X5 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnot8Q9D8X5 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnot8Q9D8X5 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnot8Q9D8X5 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnot8Q9D8X5 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnot8Q9D8X5 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnot8Q9D8X5 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnot8Q9D8X5 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnot8Q9D8X5 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnot8Q9D8X5 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnot8Q9D8X5 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnot8Q9D8X5 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnot8Q9D8X5 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnot8Q9D8X5 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnot8Q9D8X5 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnot8Q9D8X5 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnot8Q9D8X5 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnot8Q9D8X5 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnot8Q9D8X5 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnot8Q9D8X5 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnot8Q9D8X5 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnot8Q9D8X5 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnot8Q9D8X5 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnot8Q9D8X5 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnot8Q9D8X5 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnot8Q9D8X5 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnot8Q9D8X5 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnot8Q9D8X5 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnot8Q9D8X5 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnot8Q9D8X5 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnot8Q9D8X5 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnot8Q9D8X5 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnot8Q9D8X5 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnot8Q9D8X5 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnot8Q9D8X5 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnot8Q9D8X5 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnot8Q9D8X5 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnot8Q9D8X5 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnot8Q9D8X5 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnot8Q9D8X5 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnot8Q9D8X5 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnot8Q9D8X5 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnot8Q9D8X5 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnot8Q9D8X5 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnot8Q9D8X5 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnot8Q9D8X5 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnot8Q9D8X5 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnot8Q9D8X5 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnot8Q9D8X5 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnot8Q9D8X5 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnot8Q9D8X5 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnot8Q9D8X5 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnot8Q9D8X5 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnot8Q9D8X5 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnot8Q9D8X5 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnot8Q9D8X5 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnot8Q9D8X5 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cnot8Q9D8X5 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnot8Q9D8X5 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnot8Q9D8X5 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnot8Q9D8X5 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnot8Q9D8X5 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnot8Q9D8X5 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnot8Q9D8X5 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnot8Q9D8X5 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnot8Q9D8X5 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnot8Q9D8X5 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnot8Q9D8X5 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnot8Q9D8X5 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnot8Q9D8X5 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnot8Q9D8X5 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnot8Q9D8X5 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnot8Q9D8X5 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnot8Q9D8X5 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnot8Q9D8X5 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnot8Q9D8X5 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnot8Q9D8X5 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnot8Q9D8X5 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnot8Q9D8X5 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnot8Q9D8X5 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnot8Q9D8X5 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnot8Q9D8X5 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnot8Q9D8X5 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnot8Q9D8X5 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms