Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U8

Snx5, Sorting nexin-5, mousemouse

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Length 404 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx5Q9D8U8 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx5Q9D8U8 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx5Q9D8U8 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx5Q9D8U8 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx5Q9D8U8 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx5Q9D8U8 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx5Q9D8U8 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx5Q9D8U8 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx5Q9D8U8 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx5Q9D8U8 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx5Q9D8U8 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx5Q9D8U8 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx5Q9D8U8 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx5Q9D8U8 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx5Q9D8U8 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx5Q9D8U8 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx5Q9D8U8 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx5Q9D8U8 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx5Q9D8U8 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx5Q9D8U8 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx5Q9D8U8 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx5Q9D8U8 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx5Q9D8U8 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx5Q9D8U8 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx5Q9D8U8 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx5Q9D8U8 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx5Q9D8U8 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx5Q9D8U8 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx5Q9D8U8 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx5Q9D8U8 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx5Q9D8U8 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx5Q9D8U8 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx5Q9D8U8 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx5Q9D8U8 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx5Q9D8U8 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx5Q9D8U8 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx5Q9D8U8 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx5Q9D8U8 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx5Q9D8U8 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx5Q9D8U8 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx5Q9D8U8 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx5Q9D8U8 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx5Q9D8U8 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx5Q9D8U8 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx5Q9D8U8 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx5Q9D8U8 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx5Q9D8U8 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx5Q9D8U8 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx5Q9D8U8 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx5Q9D8U8 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx5Q9D8U8 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx5Q9D8U8 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx5Q9D8U8 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx5Q9D8U8 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx5Q9D8U8 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx5Q9D8U8 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx5Q9D8U8 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx5Q9D8U8 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx5Q9D8U8 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx5Q9D8U8 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx5Q9D8U8 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx5Q9D8U8 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx5Q9D8U8 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx5Q9D8U8 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx5Q9D8U8 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx5Q9D8U8 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx5Q9D8U8 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx5Q9D8U8 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx5Q9D8U8 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx5Q9D8U8 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx5Q9D8U8 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx5Q9D8U8 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx5Q9D8U8 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx5Q9D8U8 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx5Q9D8U8 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx5Q9D8U8 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx5Q9D8U8 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx5Q9D8U8 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx5Q9D8U8 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx5Q9D8U8 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx5Q9D8U8 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx5Q9D8U8 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx5Q9D8U8 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx5Q9D8U8 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx5Q9D8U8 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx5Q9D8U8 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx5Q9D8U8 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx5Q9D8U8 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx5Q9D8U8 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx5Q9D8U8 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx5Q9D8U8 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx5Q9D8U8 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx5Q9D8U8 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx5Q9D8U8 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx5Q9D8U8 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx5Q9D8U8 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx5Q9D8U8 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx5Q9D8U8 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx5Q9D8U8 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx5Q9D8U8 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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