Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T4

Tvp23b, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tvp23bQ9D8T4 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tvp23bQ9D8T4 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Tvp23bQ9D8T4 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tvp23bQ9D8T4 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tvp23bQ9D8T4 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tvp23bQ9D8T4 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tvp23bQ9D8T4 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tvp23bQ9D8T4 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tvp23bQ9D8T4 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tvp23bQ9D8T4 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tvp23bQ9D8T4 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tvp23bQ9D8T4 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tvp23bQ9D8T4 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tvp23bQ9D8T4 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Tvp23bQ9D8T4 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tvp23bQ9D8T4 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tvp23bQ9D8T4 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tvp23bQ9D8T4 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tvp23bQ9D8T4 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tvp23bQ9D8T4 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tvp23bQ9D8T4 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tvp23bQ9D8T4 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tvp23bQ9D8T4 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tvp23bQ9D8T4 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tvp23bQ9D8T4 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tvp23bQ9D8T4 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tvp23bQ9D8T4 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tvp23bQ9D8T4 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tvp23bQ9D8T4 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tvp23bQ9D8T4 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tvp23bQ9D8T4 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Tvp23bQ9D8T4 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tvp23bQ9D8T4 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tvp23bQ9D8T4 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tvp23bQ9D8T4 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tvp23bQ9D8T4 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tvp23bQ9D8T4 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tvp23bQ9D8T4 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tvp23bQ9D8T4 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tvp23bQ9D8T4 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tvp23bQ9D8T4 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Tvp23bQ9D8T4 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tvp23bQ9D8T4 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tvp23bQ9D8T4 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tvp23bQ9D8T4 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tvp23bQ9D8T4 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tvp23bQ9D8T4 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tvp23bQ9D8T4 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tvp23bQ9D8T4 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tvp23bQ9D8T4 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tvp23bQ9D8T4 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tvp23bQ9D8T4 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Tvp23bQ9D8T4 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tvp23bQ9D8T4 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tvp23bQ9D8T4 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tvp23bQ9D8T4 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tvp23bQ9D8T4 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tvp23bQ9D8T4 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tvp23bQ9D8T4 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tvp23bQ9D8T4 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tvp23bQ9D8T4 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tvp23bQ9D8T4 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Tvp23bQ9D8T4 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tvp23bQ9D8T4 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tvp23bQ9D8T4 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tvp23bQ9D8T4 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tvp23bQ9D8T4 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Tvp23bQ9D8T4 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tvp23bQ9D8T4 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tvp23bQ9D8T4 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tvp23bQ9D8T4 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tvp23bQ9D8T4 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tvp23bQ9D8T4 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tvp23bQ9D8T4 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tvp23bQ9D8T4 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tvp23bQ9D8T4 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tvp23bQ9D8T4 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tvp23bQ9D8T4 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Tvp23bQ9D8T4 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Tvp23bQ9D8T4 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tvp23bQ9D8T4 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tvp23bQ9D8T4 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tvp23bQ9D8T4 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tvp23bQ9D8T4 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Tvp23bQ9D8T4 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tvp23bQ9D8T4 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tvp23bQ9D8T4 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tvp23bQ9D8T4 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tvp23bQ9D8T4 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tvp23bQ9D8T4 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tvp23bQ9D8T4 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tvp23bQ9D8T4 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tvp23bQ9D8T4 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tvp23bQ9D8T4 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tvp23bQ9D8T4 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tvp23bQ9D8T4 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tvp23bQ9D8T4 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tvp23bQ9D8T4 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tvp23bQ9D8T4 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tvp23bQ9D8T4 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms