Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8K3

Derl3, Derlin-3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Derl3Q9D8K3 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Derl3Q9D8K3 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Derl3Q9D8K3 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Derl3Q9D8K3 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Derl3Q9D8K3 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Derl3Q9D8K3 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Derl3Q9D8K3 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Derl3Q9D8K3 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Derl3Q9D8K3 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Derl3Q9D8K3 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Derl3Q9D8K3 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Derl3Q9D8K3 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Derl3Q9D8K3 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Derl3Q9D8K3 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Derl3Q9D8K3 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Derl3Q9D8K3 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Derl3Q9D8K3 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Derl3Q9D8K3 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Derl3Q9D8K3 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Derl3Q9D8K3 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Derl3Q9D8K3 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Derl3Q9D8K3 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Derl3Q9D8K3 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Derl3Q9D8K3 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Derl3Q9D8K3 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Derl3Q9D8K3 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Derl3Q9D8K3 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Derl3Q9D8K3 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Derl3Q9D8K3 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Derl3Q9D8K3 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Derl3Q9D8K3 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Derl3Q9D8K3 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Derl3Q9D8K3 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Derl3Q9D8K3 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Derl3Q9D8K3 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Derl3Q9D8K3 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Derl3Q9D8K3 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Derl3Q9D8K3 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Derl3Q9D8K3 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Derl3Q9D8K3 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Derl3Q9D8K3 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Derl3Q9D8K3 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Derl3Q9D8K3 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Derl3Q9D8K3 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Derl3Q9D8K3 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Derl3Q9D8K3 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Derl3Q9D8K3 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Derl3Q9D8K3 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Derl3Q9D8K3 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Derl3Q9D8K3 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Derl3Q9D8K3 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Derl3Q9D8K3 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Derl3Q9D8K3 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Derl3Q9D8K3 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Derl3Q9D8K3 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Derl3Q9D8K3 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Derl3Q9D8K3 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Derl3Q9D8K3 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Derl3Q9D8K3 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Derl3Q9D8K3 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Derl3Q9D8K3 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Derl3Q9D8K3 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Derl3Q9D8K3 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Derl3Q9D8K3 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Derl3Q9D8K3 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Derl3Q9D8K3 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Derl3Q9D8K3 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Derl3Q9D8K3 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Derl3Q9D8K3 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Derl3Q9D8K3 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Derl3Q9D8K3 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Derl3Q9D8K3 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Derl3Q9D8K3 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Derl3Q9D8K3 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Derl3Q9D8K3 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Derl3Q9D8K3 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Derl3Q9D8K3 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Derl3Q9D8K3 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Derl3Q9D8K3 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Derl3Q9D8K3 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Derl3Q9D8K3 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Derl3Q9D8K3 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Derl3Q9D8K3 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Derl3Q9D8K3 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Derl3Q9D8K3 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Derl3Q9D8K3 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Derl3Q9D8K3 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Derl3Q9D8K3 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Derl3Q9D8K3 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Derl3Q9D8K3 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Derl3Q9D8K3 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Derl3Q9D8K3 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Derl3Q9D8K3 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Derl3Q9D8K3 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Derl3Q9D8K3 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Derl3Q9D8K3 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Derl3Q9D8K3 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Derl3Q9D8K3 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Derl3Q9D8K3 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Derl3Q9D8K3 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms