Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7L5

2310002L09Rik, RIKEN cDNA 2310002L09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2310002L09RikQ9D7L5 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
2310002L09RikQ9D7L5 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
2310002L09RikQ9D7L5 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
2310002L09RikQ9D7L5 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
2310002L09RikQ9D7L5 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
2310002L09RikQ9D7L5 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
2310002L09RikQ9D7L5 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
2310002L09RikQ9D7L5 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
2310002L09RikQ9D7L5 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
2310002L09RikQ9D7L5 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
2310002L09RikQ9D7L5 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
2310002L09RikQ9D7L5 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
2310002L09RikQ9D7L5 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
2310002L09RikQ9D7L5 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
2310002L09RikQ9D7L5 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
2310002L09RikQ9D7L5 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
2310002L09RikQ9D7L5 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
2310002L09RikQ9D7L5 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
2310002L09RikQ9D7L5 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
2310002L09RikQ9D7L5 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
2310002L09RikQ9D7L5 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
2310002L09RikQ9D7L5 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
2310002L09RikQ9D7L5 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
2310002L09RikQ9D7L5 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
2310002L09RikQ9D7L5 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
2310002L09RikQ9D7L5 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
2310002L09RikQ9D7L5 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
2310002L09RikQ9D7L5 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
2310002L09RikQ9D7L5 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
2310002L09RikQ9D7L5 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
2310002L09RikQ9D7L5 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
2310002L09RikQ9D7L5 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
2310002L09RikQ9D7L5 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
2310002L09RikQ9D7L5 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
2310002L09RikQ9D7L5 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
2310002L09RikQ9D7L5 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
2310002L09RikQ9D7L5 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
2310002L09RikQ9D7L5 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
2310002L09RikQ9D7L5 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
2310002L09RikQ9D7L5 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
2310002L09RikQ9D7L5 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
2310002L09RikQ9D7L5 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
2310002L09RikQ9D7L5 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
2310002L09RikQ9D7L5 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
2310002L09RikQ9D7L5 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
2310002L09RikQ9D7L5 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
2310002L09RikQ9D7L5 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
2310002L09RikQ9D7L5 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
2310002L09RikQ9D7L5 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
2310002L09RikQ9D7L5 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
2310002L09RikQ9D7L5 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
2310002L09RikQ9D7L5 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
2310002L09RikQ9D7L5 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
2310002L09RikQ9D7L5 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
2310002L09RikQ9D7L5 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
2310002L09RikQ9D7L5 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
2310002L09RikQ9D7L5 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
2310002L09RikQ9D7L5 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
2310002L09RikQ9D7L5 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
2310002L09RikQ9D7L5 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
2310002L09RikQ9D7L5 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
2310002L09RikQ9D7L5 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
2310002L09RikQ9D7L5 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
2310002L09RikQ9D7L5 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
2310002L09RikQ9D7L5 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
2310002L09RikQ9D7L5 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
2310002L09RikQ9D7L5 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
2310002L09RikQ9D7L5 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
2310002L09RikQ9D7L5 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
2310002L09RikQ9D7L5 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
2310002L09RikQ9D7L5 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
2310002L09RikQ9D7L5 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
2310002L09RikQ9D7L5 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
2310002L09RikQ9D7L5 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
2310002L09RikQ9D7L5 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
2310002L09RikQ9D7L5 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
2310002L09RikQ9D7L5 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
2310002L09RikQ9D7L5 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
2310002L09RikQ9D7L5 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
2310002L09RikQ9D7L5 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
2310002L09RikQ9D7L5 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
2310002L09RikQ9D7L5 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
2310002L09RikQ9D7L5 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
2310002L09RikQ9D7L5 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
2310002L09RikQ9D7L5 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
2310002L09RikQ9D7L5 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
2310002L09RikQ9D7L5 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
2310002L09RikQ9D7L5 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
2310002L09RikQ9D7L5 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
2310002L09RikQ9D7L5 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
2310002L09RikQ9D7L5 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
2310002L09RikQ9D7L5 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
2310002L09RikQ9D7L5 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
2310002L09RikQ9D7L5 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
2310002L09RikQ9D7L5 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
2310002L09RikQ9D7L5 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
2310002L09RikQ9D7L5 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
2310002L09RikQ9D7L5 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
2310002L09RikQ9D7L5 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
2310002L09RikQ9D7L5 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms