Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7F7

Chmp4c, Charged multivesicular body protein 4c, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4cQ9D7F7 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Chmp4cQ9D7F7 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Chmp4cQ9D7F7 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Chmp4cQ9D7F7 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Chmp4cQ9D7F7 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Chmp4cQ9D7F7 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Chmp4cQ9D7F7 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Chmp4cQ9D7F7 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Chmp4cQ9D7F7 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Chmp4cQ9D7F7 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Chmp4cQ9D7F7 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Chmp4cQ9D7F7 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Chmp4cQ9D7F7 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Chmp4cQ9D7F7 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Chmp4cQ9D7F7 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Chmp4cQ9D7F7 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Chmp4cQ9D7F7 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Chmp4cQ9D7F7 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Chmp4cQ9D7F7 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Chmp4cQ9D7F7 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Chmp4cQ9D7F7 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Chmp4cQ9D7F7 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Chmp4cQ9D7F7 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Chmp4cQ9D7F7 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Chmp4cQ9D7F7 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Chmp4cQ9D7F7 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Chmp4cQ9D7F7 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Chmp4cQ9D7F7 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Chmp4cQ9D7F7 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Chmp4cQ9D7F7 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Chmp4cQ9D7F7 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Chmp4cQ9D7F7 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Chmp4cQ9D7F7 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Chmp4cQ9D7F7 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Chmp4cQ9D7F7 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Chmp4cQ9D7F7 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Chmp4cQ9D7F7 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Chmp4cQ9D7F7 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Chmp4cQ9D7F7 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Chmp4cQ9D7F7 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Chmp4cQ9D7F7 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Chmp4cQ9D7F7 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Chmp4cQ9D7F7 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Chmp4cQ9D7F7 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Chmp4cQ9D7F7 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Chmp4cQ9D7F7 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Chmp4cQ9D7F7 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Chmp4cQ9D7F7 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Chmp4cQ9D7F7 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Chmp4cQ9D7F7 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Chmp4cQ9D7F7 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Chmp4cQ9D7F7 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Chmp4cQ9D7F7 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Chmp4cQ9D7F7 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Chmp4cQ9D7F7 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Chmp4cQ9D7F7 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Chmp4cQ9D7F7 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Chmp4cQ9D7F7 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Chmp4cQ9D7F7 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Chmp4cQ9D7F7 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Chmp4cQ9D7F7 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Chmp4cQ9D7F7 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Chmp4cQ9D7F7 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Chmp4cQ9D7F7 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Chmp4cQ9D7F7 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Chmp4cQ9D7F7 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Chmp4cQ9D7F7 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Chmp4cQ9D7F7 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Chmp4cQ9D7F7 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Chmp4cQ9D7F7 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Chmp4cQ9D7F7 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Chmp4cQ9D7F7 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Chmp4cQ9D7F7 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Chmp4cQ9D7F7 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Chmp4cQ9D7F7 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Chmp4cQ9D7F7 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Chmp4cQ9D7F7 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Chmp4cQ9D7F7 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Chmp4cQ9D7F7 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Chmp4cQ9D7F7 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Chmp4cQ9D7F7 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Chmp4cQ9D7F7 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Chmp4cQ9D7F7 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Chmp4cQ9D7F7 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Chmp4cQ9D7F7 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Chmp4cQ9D7F7 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Chmp4cQ9D7F7 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Chmp4cQ9D7F7 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Chmp4cQ9D7F7 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Chmp4cQ9D7F7 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Chmp4cQ9D7F7 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Chmp4cQ9D7F7 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Chmp4cQ9D7F7 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Chmp4cQ9D7F7 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Chmp4cQ9D7F7 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Chmp4cQ9D7F7 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Chmp4cQ9D7F7 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Chmp4cQ9D7F7 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Chmp4cQ9D7F7 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Chmp4cQ9D7F7 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms