Protein–RNA interactions for Protein: Q9D777

Tnfsf13, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf13Q9D777 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf13Q9D777 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf13Q9D777 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf13Q9D777 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf13Q9D777 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf13Q9D777 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf13Q9D777 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf13Q9D777 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf13Q9D777 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf13Q9D777 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf13Q9D777 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf13Q9D777 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf13Q9D777 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf13Q9D777 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf13Q9D777 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsf13Q9D777 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsf13Q9D777 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsf13Q9D777 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsf13Q9D777 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsf13Q9D777 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsf13Q9D777 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsf13Q9D777 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsf13Q9D777 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsf13Q9D777 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsf13Q9D777 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsf13Q9D777 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsf13Q9D777 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsf13Q9D777 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsf13Q9D777 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsf13Q9D777 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsf13Q9D777 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsf13Q9D777 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsf13Q9D777 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsf13Q9D777 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsf13Q9D777 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsf13Q9D777 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsf13Q9D777 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsf13Q9D777 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsf13Q9D777 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Tnfsf13Q9D777 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Tnfsf13Q9D777 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tnfsf13Q9D777 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tnfsf13Q9D777 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Tnfsf13Q9D777 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tnfsf13Q9D777 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tnfsf13Q9D777 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tnfsf13Q9D777 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tnfsf13Q9D777 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Tnfsf13Q9D777 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tnfsf13Q9D777 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tnfsf13Q9D777 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfsf13Q9D777 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfsf13Q9D777 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tnfsf13Q9D777 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfsf13Q9D777 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfsf13Q9D777 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tnfsf13Q9D777 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfsf13Q9D777 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfsf13Q9D777 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfsf13Q9D777 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfsf13Q9D777 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfsf13Q9D777 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfsf13Q9D777 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfsf13Q9D777 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfsf13Q9D777 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfsf13Q9D777 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfsf13Q9D777 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfsf13Q9D777 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfsf13Q9D777 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tnfsf13Q9D777 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfsf13Q9D777 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfsf13Q9D777 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfsf13Q9D777 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfsf13Q9D777 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfsf13Q9D777 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfsf13Q9D777 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsf13Q9D777 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsf13Q9D777 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsf13Q9D777 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsf13Q9D777 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsf13Q9D777 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsf13Q9D777 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsf13Q9D777 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsf13Q9D777 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsf13Q9D777 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsf13Q9D777 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsf13Q9D777 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsf13Q9D777 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsf13Q9D777 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsf13Q9D777 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsf13Q9D777 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsf13Q9D777 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsf13Q9D777 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsf13Q9D777 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsf13Q9D777 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsf13Q9D777 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsf13Q9D777 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsf13Q9D777 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsf13Q9D777 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsf13Q9D777 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms