Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nop56Q9D6Z1 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nop56Q9D6Z1 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nop56Q9D6Z1 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nop56Q9D6Z1 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nop56Q9D6Z1 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nop56Q9D6Z1 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nop56Q9D6Z1 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nop56Q9D6Z1 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nop56Q9D6Z1 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nop56Q9D6Z1 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nop56Q9D6Z1 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nop56Q9D6Z1 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nop56Q9D6Z1 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nop56Q9D6Z1 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nop56Q9D6Z1 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nop56Q9D6Z1 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nop56Q9D6Z1 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nop56Q9D6Z1 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nop56Q9D6Z1 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nop56Q9D6Z1 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nop56Q9D6Z1 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nop56Q9D6Z1 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nop56Q9D6Z1 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Nop56Q9D6Z1 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nop56Q9D6Z1 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nop56Q9D6Z1 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nop56Q9D6Z1 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nop56Q9D6Z1 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nop56Q9D6Z1 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nop56Q9D6Z1 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nop56Q9D6Z1 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nop56Q9D6Z1 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nop56Q9D6Z1 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nop56Q9D6Z1 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nop56Q9D6Z1 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nop56Q9D6Z1 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nop56Q9D6Z1 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nop56Q9D6Z1 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nop56Q9D6Z1 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nop56Q9D6Z1 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nop56Q9D6Z1 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nop56Q9D6Z1 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nop56Q9D6Z1 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nop56Q9D6Z1 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Nop56Q9D6Z1 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nop56Q9D6Z1 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nop56Q9D6Z1 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nop56Q9D6Z1 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nop56Q9D6Z1 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nop56Q9D6Z1 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nop56Q9D6Z1 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Nop56Q9D6Z1 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nop56Q9D6Z1 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nop56Q9D6Z1 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Nop56Q9D6Z1 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nop56Q9D6Z1 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nop56Q9D6Z1 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nop56Q9D6Z1 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nop56Q9D6Z1 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nop56Q9D6Z1 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nop56Q9D6Z1 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nop56Q9D6Z1 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nop56Q9D6Z1 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nop56Q9D6Z1 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nop56Q9D6Z1 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nop56Q9D6Z1 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nop56Q9D6Z1 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Nop56Q9D6Z1 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nop56Q9D6Z1 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nop56Q9D6Z1 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nop56Q9D6Z1 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nop56Q9D6Z1 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nop56Q9D6Z1 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nop56Q9D6Z1 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nop56Q9D6Z1 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nop56Q9D6Z1 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Nop56Q9D6Z1 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Nop56Q9D6Z1 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nop56Q9D6Z1 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nop56Q9D6Z1 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nop56Q9D6Z1 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nop56Q9D6Z1 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nop56Q9D6Z1 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nop56Q9D6Z1 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nop56Q9D6Z1 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nop56Q9D6Z1 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nop56Q9D6Z1 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nop56Q9D6Z1 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nop56Q9D6Z1 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nop56Q9D6Z1 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nop56Q9D6Z1 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nop56Q9D6Z1 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nop56Q9D6Z1 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nop56Q9D6Z1 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nop56Q9D6Z1 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nop56Q9D6Z1 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nop56Q9D6Z1 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nop56Q9D6Z1 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nop56Q9D6Z1 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
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