Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J3

Ccdc94, Coiled-coil domain-containing protein 94, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc94Q9D6J3 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc94Q9D6J3 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc94Q9D6J3 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc94Q9D6J3 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc94Q9D6J3 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc94Q9D6J3 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc94Q9D6J3 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc94Q9D6J3 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc94Q9D6J3 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc94Q9D6J3 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc94Q9D6J3 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc94Q9D6J3 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc94Q9D6J3 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc94Q9D6J3 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc94Q9D6J3 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc94Q9D6J3 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc94Q9D6J3 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc94Q9D6J3 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc94Q9D6J3 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc94Q9D6J3 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc94Q9D6J3 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc94Q9D6J3 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc94Q9D6J3 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc94Q9D6J3 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc94Q9D6J3 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc94Q9D6J3 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc94Q9D6J3 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc94Q9D6J3 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc94Q9D6J3 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc94Q9D6J3 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc94Q9D6J3 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc94Q9D6J3 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc94Q9D6J3 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc94Q9D6J3 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ccdc94Q9D6J3 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc94Q9D6J3 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc94Q9D6J3 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc94Q9D6J3 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc94Q9D6J3 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc94Q9D6J3 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc94Q9D6J3 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc94Q9D6J3 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc94Q9D6J3 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc94Q9D6J3 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc94Q9D6J3 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc94Q9D6J3 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc94Q9D6J3 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc94Q9D6J3 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc94Q9D6J3 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc94Q9D6J3 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc94Q9D6J3 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc94Q9D6J3 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc94Q9D6J3 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc94Q9D6J3 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc94Q9D6J3 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc94Q9D6J3 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc94Q9D6J3 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc94Q9D6J3 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc94Q9D6J3 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc94Q9D6J3 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc94Q9D6J3 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc94Q9D6J3 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc94Q9D6J3 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc94Q9D6J3 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc94Q9D6J3 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc94Q9D6J3 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc94Q9D6J3 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc94Q9D6J3 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc94Q9D6J3 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc94Q9D6J3 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc94Q9D6J3 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc94Q9D6J3 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc94Q9D6J3 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc94Q9D6J3 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc94Q9D6J3 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc94Q9D6J3 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc94Q9D6J3 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc94Q9D6J3 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc94Q9D6J3 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc94Q9D6J3 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc94Q9D6J3 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc94Q9D6J3 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc94Q9D6J3 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc94Q9D6J3 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc94Q9D6J3 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc94Q9D6J3 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc94Q9D6J3 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc94Q9D6J3 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc94Q9D6J3 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc94Q9D6J3 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc94Q9D6J3 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc94Q9D6J3 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc94Q9D6J3 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc94Q9D6J3 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc94Q9D6J3 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc94Q9D6J3 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc94Q9D6J3 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc94Q9D6J3 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc94Q9D6J3 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc94Q9D6J3 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms