Protein–RNA interactions for Protein: Q9D658

Ptp4a3, Protein tyrosine phosphatase type IVA 3, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptp4a3Q9D658 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ptp4a3Q9D658 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ptp4a3Q9D658 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ptp4a3Q9D658 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ptp4a3Q9D658 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ptp4a3Q9D658 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Ptp4a3Q9D658 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ptp4a3Q9D658 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ptp4a3Q9D658 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ptp4a3Q9D658 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ptp4a3Q9D658 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Ptp4a3Q9D658 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ptp4a3Q9D658 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ptp4a3Q9D658 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ptp4a3Q9D658 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ptp4a3Q9D658 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ptp4a3Q9D658 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ptp4a3Q9D658 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ptp4a3Q9D658 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ptp4a3Q9D658 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ptp4a3Q9D658 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ptp4a3Q9D658 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ptp4a3Q9D658 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ptp4a3Q9D658 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ptp4a3Q9D658 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ptp4a3Q9D658 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ptp4a3Q9D658 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ptp4a3Q9D658 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ptp4a3Q9D658 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ptp4a3Q9D658 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ptp4a3Q9D658 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ptp4a3Q9D658 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ptp4a3Q9D658 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Ptp4a3Q9D658 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ptp4a3Q9D658 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Ptp4a3Q9D658 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ptp4a3Q9D658 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ptp4a3Q9D658 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ptp4a3Q9D658 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Ptp4a3Q9D658 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ptp4a3Q9D658 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Ptp4a3Q9D658 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ptp4a3Q9D658 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ptp4a3Q9D658 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ptp4a3Q9D658 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ptp4a3Q9D658 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ptp4a3Q9D658 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ptp4a3Q9D658 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ptp4a3Q9D658 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ptp4a3Q9D658 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ptp4a3Q9D658 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Ptp4a3Q9D658 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ptp4a3Q9D658 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ptp4a3Q9D658 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ptp4a3Q9D658 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ptp4a3Q9D658 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ptp4a3Q9D658 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ptp4a3Q9D658 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ptp4a3Q9D658 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ptp4a3Q9D658 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ptp4a3Q9D658 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ptp4a3Q9D658 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ptp4a3Q9D658 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ptp4a3Q9D658 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ptp4a3Q9D658 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ptp4a3Q9D658 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ptp4a3Q9D658 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ptp4a3Q9D658 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ptp4a3Q9D658 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ptp4a3Q9D658 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ptp4a3Q9D658 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ptp4a3Q9D658 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ptp4a3Q9D658 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ptp4a3Q9D658 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ptp4a3Q9D658 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ptp4a3Q9D658 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ptp4a3Q9D658 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ptp4a3Q9D658 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ptp4a3Q9D658 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ptp4a3Q9D658 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ptp4a3Q9D658 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ptp4a3Q9D658 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ptp4a3Q9D658 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ptp4a3Q9D658 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ptp4a3Q9D658 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ptp4a3Q9D658 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ptp4a3Q9D658 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ptp4a3Q9D658 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ptp4a3Q9D658 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ptp4a3Q9D658 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ptp4a3Q9D658 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ptp4a3Q9D658 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ptp4a3Q9D658 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Ptp4a3Q9D658 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ptp4a3Q9D658 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Ptp4a3Q9D658 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Ptp4a3Q9D658 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Ptp4a3Q9D658 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ptp4a3Q9D658 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ptp4a3Q9D658 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms