Protein–RNA interactions for Protein: Q9D620

Rab11fip1, Rab11 family-interacting protein 1, mousemouse

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Length 645 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip1Q9D620 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rab11fip1Q9D620 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rab11fip1Q9D620 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rab11fip1Q9D620 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rab11fip1Q9D620 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab11fip1Q9D620 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab11fip1Q9D620 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab11fip1Q9D620 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab11fip1Q9D620 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab11fip1Q9D620 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab11fip1Q9D620 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab11fip1Q9D620 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab11fip1Q9D620 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab11fip1Q9D620 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab11fip1Q9D620 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab11fip1Q9D620 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab11fip1Q9D620 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab11fip1Q9D620 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab11fip1Q9D620 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab11fip1Q9D620 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab11fip1Q9D620 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab11fip1Q9D620 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab11fip1Q9D620 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab11fip1Q9D620 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab11fip1Q9D620 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab11fip1Q9D620 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab11fip1Q9D620 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab11fip1Q9D620 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab11fip1Q9D620 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab11fip1Q9D620 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab11fip1Q9D620 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab11fip1Q9D620 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab11fip1Q9D620 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab11fip1Q9D620 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab11fip1Q9D620 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab11fip1Q9D620 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab11fip1Q9D620 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab11fip1Q9D620 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab11fip1Q9D620 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab11fip1Q9D620 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab11fip1Q9D620 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab11fip1Q9D620 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab11fip1Q9D620 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab11fip1Q9D620 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab11fip1Q9D620 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab11fip1Q9D620 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab11fip1Q9D620 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab11fip1Q9D620 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab11fip1Q9D620 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab11fip1Q9D620 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab11fip1Q9D620 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab11fip1Q9D620 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab11fip1Q9D620 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab11fip1Q9D620 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab11fip1Q9D620 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
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Rab11fip1Q9D620 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab11fip1Q9D620 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab11fip1Q9D620 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab11fip1Q9D620 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab11fip1Q9D620 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab11fip1Q9D620 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab11fip1Q9D620 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Rab11fip1Q9D620 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Rab11fip1Q9D620 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab11fip1Q9D620 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab11fip1Q9D620 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab11fip1Q9D620 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab11fip1Q9D620 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab11fip1Q9D620 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab11fip1Q9D620 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab11fip1Q9D620 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab11fip1Q9D620 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab11fip1Q9D620 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab11fip1Q9D620 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab11fip1Q9D620 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab11fip1Q9D620 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab11fip1Q9D620 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab11fip1Q9D620 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab11fip1Q9D620 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab11fip1Q9D620 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab11fip1Q9D620 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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