Protein–RNA interactions for Protein: Q9D516

Ccdc130, Coiled-coil domain-containing protein 130, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc130Q9D516 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc130Q9D516 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc130Q9D516 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc130Q9D516 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc130Q9D516 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc130Q9D516 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc130Q9D516 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc130Q9D516 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc130Q9D516 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc130Q9D516 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc130Q9D516 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc130Q9D516 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc130Q9D516 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc130Q9D516 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc130Q9D516 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc130Q9D516 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc130Q9D516 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc130Q9D516 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc130Q9D516 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc130Q9D516 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc130Q9D516 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc130Q9D516 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc130Q9D516 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc130Q9D516 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc130Q9D516 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc130Q9D516 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc130Q9D516 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc130Q9D516 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc130Q9D516 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc130Q9D516 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc130Q9D516 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc130Q9D516 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc130Q9D516 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc130Q9D516 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc130Q9D516 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc130Q9D516 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc130Q9D516 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc130Q9D516 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc130Q9D516 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc130Q9D516 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc130Q9D516 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc130Q9D516 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc130Q9D516 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc130Q9D516 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc130Q9D516 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc130Q9D516 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc130Q9D516 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc130Q9D516 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc130Q9D516 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc130Q9D516 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc130Q9D516 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc130Q9D516 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc130Q9D516 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc130Q9D516 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc130Q9D516 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc130Q9D516 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc130Q9D516 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc130Q9D516 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc130Q9D516 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc130Q9D516 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc130Q9D516 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc130Q9D516 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc130Q9D516 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc130Q9D516 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc130Q9D516 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc130Q9D516 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc130Q9D516 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc130Q9D516 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc130Q9D516 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc130Q9D516 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc130Q9D516 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc130Q9D516 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc130Q9D516 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc130Q9D516 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc130Q9D516 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc130Q9D516 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc130Q9D516 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc130Q9D516 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc130Q9D516 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc130Q9D516 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc130Q9D516 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc130Q9D516 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc130Q9D516 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc130Q9D516 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc130Q9D516 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc130Q9D516 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc130Q9D516 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc130Q9D516 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc130Q9D516 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc130Q9D516 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc130Q9D516 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc130Q9D516 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc130Q9D516 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc130Q9D516 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc130Q9D516 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc130Q9D516 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc130Q9D516 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc130Q9D516 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc130Q9D516 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc130Q9D516 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms