Protein–RNA interactions for Protein: Q9D489

Sohlh2, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sohlh2Q9D489 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sohlh2Q9D489 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sohlh2Q9D489 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sohlh2Q9D489 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sohlh2Q9D489 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sohlh2Q9D489 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sohlh2Q9D489 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sohlh2Q9D489 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sohlh2Q9D489 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sohlh2Q9D489 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sohlh2Q9D489 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sohlh2Q9D489 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sohlh2Q9D489 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sohlh2Q9D489 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sohlh2Q9D489 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sohlh2Q9D489 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sohlh2Q9D489 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sohlh2Q9D489 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sohlh2Q9D489 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sohlh2Q9D489 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sohlh2Q9D489 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sohlh2Q9D489 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sohlh2Q9D489 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sohlh2Q9D489 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sohlh2Q9D489 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sohlh2Q9D489 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sohlh2Q9D489 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sohlh2Q9D489 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sohlh2Q9D489 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sohlh2Q9D489 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sohlh2Q9D489 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sohlh2Q9D489 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sohlh2Q9D489 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sohlh2Q9D489 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sohlh2Q9D489 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sohlh2Q9D489 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sohlh2Q9D489 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sohlh2Q9D489 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sohlh2Q9D489 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Sohlh2Q9D489 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sohlh2Q9D489 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sohlh2Q9D489 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sohlh2Q9D489 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sohlh2Q9D489 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sohlh2Q9D489 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sohlh2Q9D489 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sohlh2Q9D489 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sohlh2Q9D489 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sohlh2Q9D489 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sohlh2Q9D489 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sohlh2Q9D489 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sohlh2Q9D489 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sohlh2Q9D489 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sohlh2Q9D489 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sohlh2Q9D489 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sohlh2Q9D489 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sohlh2Q9D489 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sohlh2Q9D489 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Sohlh2Q9D489 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sohlh2Q9D489 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sohlh2Q9D489 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sohlh2Q9D489 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sohlh2Q9D489 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sohlh2Q9D489 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sohlh2Q9D489 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sohlh2Q9D489 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sohlh2Q9D489 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sohlh2Q9D489 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sohlh2Q9D489 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sohlh2Q9D489 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sohlh2Q9D489 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sohlh2Q9D489 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sohlh2Q9D489 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Sohlh2Q9D489 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sohlh2Q9D489 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sohlh2Q9D489 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sohlh2Q9D489 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sohlh2Q9D489 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sohlh2Q9D489 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sohlh2Q9D489 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sohlh2Q9D489 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sohlh2Q9D489 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sohlh2Q9D489 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sohlh2Q9D489 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sohlh2Q9D489 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sohlh2Q9D489 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sohlh2Q9D489 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sohlh2Q9D489 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sohlh2Q9D489 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sohlh2Q9D489 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sohlh2Q9D489 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sohlh2Q9D489 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sohlh2Q9D489 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sohlh2Q9D489 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sohlh2Q9D489 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sohlh2Q9D489 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sohlh2Q9D489 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sohlh2Q9D489 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sohlh2Q9D489 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sohlh2Q9D489 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms