Protein–RNA interactions for Protein: Q9D479

Uvssa, UV-stimulated scaffold protein A, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UvssaQ9D479 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
UvssaQ9D479 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
UvssaQ9D479 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
UvssaQ9D479 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
UvssaQ9D479 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
UvssaQ9D479 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
UvssaQ9D479 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
UvssaQ9D479 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
UvssaQ9D479 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
UvssaQ9D479 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
UvssaQ9D479 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
UvssaQ9D479 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
UvssaQ9D479 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
UvssaQ9D479 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
UvssaQ9D479 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
UvssaQ9D479 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
UvssaQ9D479 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
UvssaQ9D479 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
UvssaQ9D479 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
UvssaQ9D479 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
UvssaQ9D479 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
UvssaQ9D479 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
UvssaQ9D479 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
UvssaQ9D479 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
UvssaQ9D479 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
UvssaQ9D479 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
UvssaQ9D479 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
UvssaQ9D479 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
UvssaQ9D479 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
UvssaQ9D479 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
UvssaQ9D479 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
UvssaQ9D479 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
UvssaQ9D479 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
UvssaQ9D479 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
UvssaQ9D479 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
UvssaQ9D479 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
UvssaQ9D479 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
UvssaQ9D479 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
UvssaQ9D479 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
UvssaQ9D479 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
UvssaQ9D479 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
UvssaQ9D479 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
UvssaQ9D479 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
UvssaQ9D479 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
UvssaQ9D479 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
UvssaQ9D479 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
UvssaQ9D479 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
UvssaQ9D479 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
UvssaQ9D479 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
UvssaQ9D479 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
UvssaQ9D479 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
UvssaQ9D479 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
UvssaQ9D479 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
UvssaQ9D479 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
UvssaQ9D479 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
UvssaQ9D479 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
UvssaQ9D479 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
UvssaQ9D479 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
UvssaQ9D479 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
UvssaQ9D479 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
UvssaQ9D479 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
UvssaQ9D479 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
UvssaQ9D479 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
UvssaQ9D479 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
UvssaQ9D479 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
UvssaQ9D479 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
UvssaQ9D479 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
UvssaQ9D479 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
UvssaQ9D479 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
UvssaQ9D479 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
UvssaQ9D479 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
UvssaQ9D479 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
UvssaQ9D479 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
UvssaQ9D479 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
UvssaQ9D479 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
UvssaQ9D479 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UvssaQ9D479 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UvssaQ9D479 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UvssaQ9D479 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
UvssaQ9D479 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
UvssaQ9D479 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UvssaQ9D479 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
UvssaQ9D479 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
UvssaQ9D479 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UvssaQ9D479 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
UvssaQ9D479 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UvssaQ9D479 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
UvssaQ9D479 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UvssaQ9D479 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UvssaQ9D479 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UvssaQ9D479 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UvssaQ9D479 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
UvssaQ9D479 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UvssaQ9D479 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
UvssaQ9D479 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UvssaQ9D479 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UvssaQ9D479 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UvssaQ9D479 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UvssaQ9D479 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
UvssaQ9D479 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms