Protein–RNA interactions for Protein: Q9D394

Rufy3, Protein RUFY3, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy3Q9D394 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rufy3Q9D394 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rufy3Q9D394 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rufy3Q9D394 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rufy3Q9D394 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rufy3Q9D394 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rufy3Q9D394 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rufy3Q9D394 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rufy3Q9D394 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rufy3Q9D394 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rufy3Q9D394 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rufy3Q9D394 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rufy3Q9D394 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rufy3Q9D394 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rufy3Q9D394 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rufy3Q9D394 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rufy3Q9D394 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rufy3Q9D394 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rufy3Q9D394 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rufy3Q9D394 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rufy3Q9D394 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rufy3Q9D394 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rufy3Q9D394 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rufy3Q9D394 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rufy3Q9D394 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rufy3Q9D394 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rufy3Q9D394 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rufy3Q9D394 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rufy3Q9D394 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rufy3Q9D394 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rufy3Q9D394 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rufy3Q9D394 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rufy3Q9D394 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rufy3Q9D394 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rufy3Q9D394 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rufy3Q9D394 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rufy3Q9D394 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rufy3Q9D394 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rufy3Q9D394 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rufy3Q9D394 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Rufy3Q9D394 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rufy3Q9D394 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rufy3Q9D394 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rufy3Q9D394 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rufy3Q9D394 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rufy3Q9D394 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rufy3Q9D394 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rufy3Q9D394 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rufy3Q9D394 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rufy3Q9D394 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rufy3Q9D394 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rufy3Q9D394 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rufy3Q9D394 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Rufy3Q9D394 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rufy3Q9D394 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rufy3Q9D394 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rufy3Q9D394 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rufy3Q9D394 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rufy3Q9D394 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rufy3Q9D394 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rufy3Q9D394 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rufy3Q9D394 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rufy3Q9D394 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rufy3Q9D394 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rufy3Q9D394 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rufy3Q9D394 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rufy3Q9D394 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rufy3Q9D394 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rufy3Q9D394 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rufy3Q9D394 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rufy3Q9D394 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rufy3Q9D394 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rufy3Q9D394 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rufy3Q9D394 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rufy3Q9D394 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rufy3Q9D394 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rufy3Q9D394 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rufy3Q9D394 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rufy3Q9D394 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rufy3Q9D394 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rufy3Q9D394 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rufy3Q9D394 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rufy3Q9D394 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Rufy3Q9D394 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rufy3Q9D394 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rufy3Q9D394 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rufy3Q9D394 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rufy3Q9D394 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rufy3Q9D394 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rufy3Q9D394 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rufy3Q9D394 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rufy3Q9D394 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rufy3Q9D394 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rufy3Q9D394 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rufy3Q9D394 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rufy3Q9D394 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rufy3Q9D394 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rufy3Q9D394 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rufy3Q9D394 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rufy3Q9D394 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms