Protein–RNA interactions for Protein: Q9D304

Rnf128, E3 ubiquitin-protein ligase RNF128, mousemouse

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Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf128Q9D304 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf128Q9D304 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf128Q9D304 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf128Q9D304 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf128Q9D304 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf128Q9D304 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf128Q9D304 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf128Q9D304 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf128Q9D304 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf128Q9D304 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf128Q9D304 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf128Q9D304 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf128Q9D304 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf128Q9D304 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf128Q9D304 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf128Q9D304 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf128Q9D304 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf128Q9D304 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf128Q9D304 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf128Q9D304 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Rnf128Q9D304 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf128Q9D304 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf128Q9D304 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf128Q9D304 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf128Q9D304 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf128Q9D304 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Rnf128Q9D304 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf128Q9D304 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf128Q9D304 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf128Q9D304 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf128Q9D304 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Rnf128Q9D304 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf128Q9D304 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf128Q9D304 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf128Q9D304 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf128Q9D304 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf128Q9D304 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rnf128Q9D304 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rnf128Q9D304 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rnf128Q9D304 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rnf128Q9D304 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rnf128Q9D304 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rnf128Q9D304 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
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Rnf128Q9D304 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rnf128Q9D304 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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Rnf128Q9D304 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
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Rnf128Q9D304 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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Rnf128Q9D304 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rnf128Q9D304 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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Rnf128Q9D304 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rnf128Q9D304 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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Rnf128Q9D304 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rnf128Q9D304 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rnf128Q9D304 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rnf128Q9D304 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf128Q9D304 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf128Q9D304 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf128Q9D304 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf128Q9D304 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf128Q9D304 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf128Q9D304 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf128Q9D304 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf128Q9D304 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf128Q9D304 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf128Q9D304 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf128Q9D304 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf128Q9D304 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf128Q9D304 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf128Q9D304 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf128Q9D304 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf128Q9D304 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf128Q9D304 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Rnf128Q9D304 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf128Q9D304 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf128Q9D304 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Rnf128Q9D304 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf128Q9D304 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf128Q9D304 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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