Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trappc6bQ9D289 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trappc6bQ9D289 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trappc6bQ9D289 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trappc6bQ9D289 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Trappc6bQ9D289 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trappc6bQ9D289 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trappc6bQ9D289 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trappc6bQ9D289 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trappc6bQ9D289 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trappc6bQ9D289 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trappc6bQ9D289 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trappc6bQ9D289 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trappc6bQ9D289 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trappc6bQ9D289 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trappc6bQ9D289 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trappc6bQ9D289 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trappc6bQ9D289 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trappc6bQ9D289 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trappc6bQ9D289 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trappc6bQ9D289 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trappc6bQ9D289 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trappc6bQ9D289 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trappc6bQ9D289 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trappc6bQ9D289 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trappc6bQ9D289 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trappc6bQ9D289 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Trappc6bQ9D289 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Trappc6bQ9D289 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Trappc6bQ9D289 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Trappc6bQ9D289 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Trappc6bQ9D289 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms