Protein–RNA interactions for Protein: Q9D287

Bcas2, Pre-mRNA-splicing factor SPF27, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcas2Q9D287 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bcas2Q9D287 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bcas2Q9D287 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bcas2Q9D287 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bcas2Q9D287 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bcas2Q9D287 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Bcas2Q9D287 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bcas2Q9D287 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bcas2Q9D287 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bcas2Q9D287 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bcas2Q9D287 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bcas2Q9D287 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bcas2Q9D287 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bcas2Q9D287 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bcas2Q9D287 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bcas2Q9D287 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Bcas2Q9D287 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bcas2Q9D287 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bcas2Q9D287 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bcas2Q9D287 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bcas2Q9D287 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bcas2Q9D287 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bcas2Q9D287 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bcas2Q9D287 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bcas2Q9D287 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bcas2Q9D287 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bcas2Q9D287 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bcas2Q9D287 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bcas2Q9D287 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bcas2Q9D287 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bcas2Q9D287 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bcas2Q9D287 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bcas2Q9D287 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bcas2Q9D287 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bcas2Q9D287 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bcas2Q9D287 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bcas2Q9D287 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bcas2Q9D287 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bcas2Q9D287 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bcas2Q9D287 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bcas2Q9D287 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bcas2Q9D287 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bcas2Q9D287 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bcas2Q9D287 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bcas2Q9D287 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bcas2Q9D287 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bcas2Q9D287 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bcas2Q9D287 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bcas2Q9D287 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bcas2Q9D287 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bcas2Q9D287 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bcas2Q9D287 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bcas2Q9D287 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bcas2Q9D287 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bcas2Q9D287 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bcas2Q9D287 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bcas2Q9D287 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bcas2Q9D287 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bcas2Q9D287 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bcas2Q9D287 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bcas2Q9D287 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bcas2Q9D287 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bcas2Q9D287 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bcas2Q9D287 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bcas2Q9D287 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Bcas2Q9D287 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bcas2Q9D287 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bcas2Q9D287 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bcas2Q9D287 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bcas2Q9D287 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bcas2Q9D287 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Bcas2Q9D287 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Bcas2Q9D287 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bcas2Q9D287 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Bcas2Q9D287 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bcas2Q9D287 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bcas2Q9D287 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bcas2Q9D287 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bcas2Q9D287 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bcas2Q9D287 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bcas2Q9D287 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bcas2Q9D287 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Bcas2Q9D287 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bcas2Q9D287 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bcas2Q9D287 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bcas2Q9D287 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bcas2Q9D287 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bcas2Q9D287 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bcas2Q9D287 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bcas2Q9D287 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bcas2Q9D287 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bcas2Q9D287 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bcas2Q9D287 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bcas2Q9D287 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bcas2Q9D287 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bcas2Q9D287 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bcas2Q9D287 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bcas2Q9D287 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bcas2Q9D287 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bcas2Q9D287 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms