Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1L0

Chchd2, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chchd2Q9D1L0 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chchd2Q9D1L0 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chchd2Q9D1L0 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chchd2Q9D1L0 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Chchd2Q9D1L0 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chchd2Q9D1L0 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chchd2Q9D1L0 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chchd2Q9D1L0 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chchd2Q9D1L0 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chchd2Q9D1L0 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chchd2Q9D1L0 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chchd2Q9D1L0 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Chchd2Q9D1L0 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chchd2Q9D1L0 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chchd2Q9D1L0 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chchd2Q9D1L0 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chchd2Q9D1L0 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chchd2Q9D1L0 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Chchd2Q9D1L0 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Chchd2Q9D1L0 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Chchd2Q9D1L0 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Chchd2Q9D1L0 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Chchd2Q9D1L0 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Chchd2Q9D1L0 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Chchd2Q9D1L0 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Chchd2Q9D1L0 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Chchd2Q9D1L0 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Chchd2Q9D1L0 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Chchd2Q9D1L0 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Chchd2Q9D1L0 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Chchd2Q9D1L0 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Chchd2Q9D1L0 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Chchd2Q9D1L0 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Chchd2Q9D1L0 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Chchd2Q9D1L0 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Chchd2Q9D1L0 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Chchd2Q9D1L0 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Chchd2Q9D1L0 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Chchd2Q9D1L0 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Chchd2Q9D1L0 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Chchd2Q9D1L0 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Chchd2Q9D1L0 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Chchd2Q9D1L0 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Chchd2Q9D1L0 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Chchd2Q9D1L0 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Chchd2Q9D1L0 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Chchd2Q9D1L0 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Chchd2Q9D1L0 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Chchd2Q9D1L0 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Chchd2Q9D1L0 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Chchd2Q9D1L0 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Chchd2Q9D1L0 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Chchd2Q9D1L0 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Chchd2Q9D1L0 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Chchd2Q9D1L0 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Chchd2Q9D1L0 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Chchd2Q9D1L0 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Chchd2Q9D1L0 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Chchd2Q9D1L0 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Chchd2Q9D1L0 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Chchd2Q9D1L0 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Chchd2Q9D1L0 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Chchd2Q9D1L0 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Chchd2Q9D1L0 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Chchd2Q9D1L0 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Chchd2Q9D1L0 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Chchd2Q9D1L0 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Chchd2Q9D1L0 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Chchd2Q9D1L0 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Chchd2Q9D1L0 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Chchd2Q9D1L0 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Chchd2Q9D1L0 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Chchd2Q9D1L0 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Chchd2Q9D1L0 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Chchd2Q9D1L0 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Chchd2Q9D1L0 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Chchd2Q9D1L0 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Chchd2Q9D1L0 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Chchd2Q9D1L0 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Chchd2Q9D1L0 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Chchd2Q9D1L0 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Chchd2Q9D1L0 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Chchd2Q9D1L0 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Chchd2Q9D1L0 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Chchd2Q9D1L0 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Chchd2Q9D1L0 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Chchd2Q9D1L0 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Chchd2Q9D1L0 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Chchd2Q9D1L0 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Chchd2Q9D1L0 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Chchd2Q9D1L0 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Chchd2Q9D1L0 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Chchd2Q9D1L0 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Chchd2Q9D1L0 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Chchd2Q9D1L0 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Chchd2Q9D1L0 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Chchd2Q9D1L0 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Chchd2Q9D1L0 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Chchd2Q9D1L0 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Chchd2Q9D1L0 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms