Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0Y8

Mrpl52, 39S ribosomal protein L52, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl52Q9D0Y8 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl52Q9D0Y8 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl52Q9D0Y8 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl52Q9D0Y8 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl52Q9D0Y8 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl52Q9D0Y8 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl52Q9D0Y8 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl52Q9D0Y8 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl52Q9D0Y8 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl52Q9D0Y8 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl52Q9D0Y8 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl52Q9D0Y8 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl52Q9D0Y8 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl52Q9D0Y8 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl52Q9D0Y8 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl52Q9D0Y8 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl52Q9D0Y8 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl52Q9D0Y8 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl52Q9D0Y8 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl52Q9D0Y8 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl52Q9D0Y8 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl52Q9D0Y8 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl52Q9D0Y8 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl52Q9D0Y8 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl52Q9D0Y8 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl52Q9D0Y8 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl52Q9D0Y8 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl52Q9D0Y8 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl52Q9D0Y8 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl52Q9D0Y8 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl52Q9D0Y8 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl52Q9D0Y8 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl52Q9D0Y8 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl52Q9D0Y8 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl52Q9D0Y8 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl52Q9D0Y8 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl52Q9D0Y8 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl52Q9D0Y8 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl52Q9D0Y8 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl52Q9D0Y8 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl52Q9D0Y8 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl52Q9D0Y8 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl52Q9D0Y8 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl52Q9D0Y8 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl52Q9D0Y8 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl52Q9D0Y8 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl52Q9D0Y8 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl52Q9D0Y8 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl52Q9D0Y8 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl52Q9D0Y8 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl52Q9D0Y8 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl52Q9D0Y8 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl52Q9D0Y8 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl52Q9D0Y8 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl52Q9D0Y8 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl52Q9D0Y8 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl52Q9D0Y8 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl52Q9D0Y8 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl52Q9D0Y8 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl52Q9D0Y8 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl52Q9D0Y8 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl52Q9D0Y8 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl52Q9D0Y8 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl52Q9D0Y8 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl52Q9D0Y8 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl52Q9D0Y8 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl52Q9D0Y8 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl52Q9D0Y8 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl52Q9D0Y8 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl52Q9D0Y8 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl52Q9D0Y8 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl52Q9D0Y8 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl52Q9D0Y8 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl52Q9D0Y8 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl52Q9D0Y8 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl52Q9D0Y8 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl52Q9D0Y8 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl52Q9D0Y8 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl52Q9D0Y8 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl52Q9D0Y8 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl52Q9D0Y8 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl52Q9D0Y8 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl52Q9D0Y8 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl52Q9D0Y8 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl52Q9D0Y8 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl52Q9D0Y8 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl52Q9D0Y8 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl52Q9D0Y8 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl52Q9D0Y8 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl52Q9D0Y8 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl52Q9D0Y8 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl52Q9D0Y8 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl52Q9D0Y8 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl52Q9D0Y8 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl52Q9D0Y8 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl52Q9D0Y8 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl52Q9D0Y8 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl52Q9D0Y8 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl52Q9D0Y8 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl52Q9D0Y8 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms