Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0R8

Lsm12, Protein LSM12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm12Q9D0R8 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lsm12Q9D0R8 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lsm12Q9D0R8 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lsm12Q9D0R8 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lsm12Q9D0R8 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lsm12Q9D0R8 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lsm12Q9D0R8 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lsm12Q9D0R8 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lsm12Q9D0R8 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lsm12Q9D0R8 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Lsm12Q9D0R8 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Lsm12Q9D0R8 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lsm12Q9D0R8 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lsm12Q9D0R8 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lsm12Q9D0R8 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lsm12Q9D0R8 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lsm12Q9D0R8 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lsm12Q9D0R8 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lsm12Q9D0R8 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Lsm12Q9D0R8 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lsm12Q9D0R8 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lsm12Q9D0R8 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lsm12Q9D0R8 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lsm12Q9D0R8 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lsm12Q9D0R8 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lsm12Q9D0R8 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lsm12Q9D0R8 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lsm12Q9D0R8 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lsm12Q9D0R8 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lsm12Q9D0R8 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lsm12Q9D0R8 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Lsm12Q9D0R8 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Lsm12Q9D0R8 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lsm12Q9D0R8 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Lsm12Q9D0R8 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lsm12Q9D0R8 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lsm12Q9D0R8 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lsm12Q9D0R8 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lsm12Q9D0R8 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lsm12Q9D0R8 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lsm12Q9D0R8 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lsm12Q9D0R8 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lsm12Q9D0R8 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lsm12Q9D0R8 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lsm12Q9D0R8 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lsm12Q9D0R8 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lsm12Q9D0R8 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lsm12Q9D0R8 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lsm12Q9D0R8 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lsm12Q9D0R8 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lsm12Q9D0R8 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lsm12Q9D0R8 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lsm12Q9D0R8 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lsm12Q9D0R8 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lsm12Q9D0R8 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lsm12Q9D0R8 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lsm12Q9D0R8 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lsm12Q9D0R8 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lsm12Q9D0R8 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Lsm12Q9D0R8 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lsm12Q9D0R8 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lsm12Q9D0R8 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lsm12Q9D0R8 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lsm12Q9D0R8 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Lsm12Q9D0R8 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lsm12Q9D0R8 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lsm12Q9D0R8 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lsm12Q9D0R8 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lsm12Q9D0R8 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lsm12Q9D0R8 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lsm12Q9D0R8 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lsm12Q9D0R8 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lsm12Q9D0R8 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lsm12Q9D0R8 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lsm12Q9D0R8 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lsm12Q9D0R8 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lsm12Q9D0R8 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lsm12Q9D0R8 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lsm12Q9D0R8 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lsm12Q9D0R8 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lsm12Q9D0R8 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lsm12Q9D0R8 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lsm12Q9D0R8 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lsm12Q9D0R8 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lsm12Q9D0R8 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lsm12Q9D0R8 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lsm12Q9D0R8 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lsm12Q9D0R8 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lsm12Q9D0R8 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lsm12Q9D0R8 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lsm12Q9D0R8 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lsm12Q9D0R8 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lsm12Q9D0R8 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lsm12Q9D0R8 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lsm12Q9D0R8 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lsm12Q9D0R8 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lsm12Q9D0R8 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lsm12Q9D0R8 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lsm12Q9D0R8 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lsm12Q9D0R8 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms