Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zbed3Q9D0L1 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zbed3Q9D0L1 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zbed3Q9D0L1 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zbed3Q9D0L1 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zbed3Q9D0L1 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Zbed3Q9D0L1 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Zbed3Q9D0L1 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zbed3Q9D0L1 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Zbed3Q9D0L1 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zbed3Q9D0L1 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Zbed3Q9D0L1 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zbed3Q9D0L1 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zbed3Q9D0L1 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zbed3Q9D0L1 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zbed3Q9D0L1 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zbed3Q9D0L1 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zbed3Q9D0L1 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zbed3Q9D0L1 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zbed3Q9D0L1 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zbed3Q9D0L1 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zbed3Q9D0L1 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Zbed3Q9D0L1 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Zbed3Q9D0L1 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Zbed3Q9D0L1 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zbed3Q9D0L1 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zbed3Q9D0L1 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zbed3Q9D0L1 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zbed3Q9D0L1 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zbed3Q9D0L1 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zbed3Q9D0L1 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zbed3Q9D0L1 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Zbed3Q9D0L1 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Zbed3Q9D0L1 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zbed3Q9D0L1 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zbed3Q9D0L1 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zbed3Q9D0L1 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zbed3Q9D0L1 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zbed3Q9D0L1 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zbed3Q9D0L1 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zbed3Q9D0L1 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zbed3Q9D0L1 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zbed3Q9D0L1 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zbed3Q9D0L1 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zbed3Q9D0L1 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zbed3Q9D0L1 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zbed3Q9D0L1 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zbed3Q9D0L1 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zbed3Q9D0L1 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zbed3Q9D0L1 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zbed3Q9D0L1 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zbed3Q9D0L1 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zbed3Q9D0L1 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zbed3Q9D0L1 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zbed3Q9D0L1 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zbed3Q9D0L1 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Zbed3Q9D0L1 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zbed3Q9D0L1 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zbed3Q9D0L1 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zbed3Q9D0L1 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zbed3Q9D0L1 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zbed3Q9D0L1 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zbed3Q9D0L1 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zbed3Q9D0L1 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zbed3Q9D0L1 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zbed3Q9D0L1 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zbed3Q9D0L1 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zbed3Q9D0L1 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zbed3Q9D0L1 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Zbed3Q9D0L1 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zbed3Q9D0L1 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zbed3Q9D0L1 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zbed3Q9D0L1 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zbed3Q9D0L1 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zbed3Q9D0L1 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zbed3Q9D0L1 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Zbed3Q9D0L1 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zbed3Q9D0L1 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zbed3Q9D0L1 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zbed3Q9D0L1 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zbed3Q9D0L1 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zbed3Q9D0L1 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Zbed3Q9D0L1 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zbed3Q9D0L1 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zbed3Q9D0L1 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zbed3Q9D0L1 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Zbed3Q9D0L1 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zbed3Q9D0L1 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Zbed3Q9D0L1 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Zbed3Q9D0L1 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zbed3Q9D0L1 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Zbed3Q9D0L1 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zbed3Q9D0L1 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zbed3Q9D0L1 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zbed3Q9D0L1 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zbed3Q9D0L1 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zbed3Q9D0L1 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zbed3Q9D0L1 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zbed3Q9D0L1 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zbed3Q9D0L1 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
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