Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gtf2e1Q9D0D5 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gtf2e1Q9D0D5 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Gtf2e1Q9D0D5 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gtf2e1Q9D0D5 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gtf2e1Q9D0D5 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gtf2e1Q9D0D5 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gtf2e1Q9D0D5 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gtf2e1Q9D0D5 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gtf2e1Q9D0D5 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Gtf2e1Q9D0D5 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Gtf2e1Q9D0D5 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Gtf2e1Q9D0D5 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Gtf2e1Q9D0D5 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Gtf2e1Q9D0D5 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gtf2e1Q9D0D5 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gtf2e1Q9D0D5 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Gtf2e1Q9D0D5 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Gtf2e1Q9D0D5 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Gtf2e1Q9D0D5 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gtf2e1Q9D0D5 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gtf2e1Q9D0D5 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gtf2e1Q9D0D5 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gtf2e1Q9D0D5 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gtf2e1Q9D0D5 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gtf2e1Q9D0D5 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gtf2e1Q9D0D5 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gtf2e1Q9D0D5 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gtf2e1Q9D0D5 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gtf2e1Q9D0D5 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gtf2e1Q9D0D5 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gtf2e1Q9D0D5 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gtf2e1Q9D0D5 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gtf2e1Q9D0D5 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gtf2e1Q9D0D5 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gtf2e1Q9D0D5 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gtf2e1Q9D0D5 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gtf2e1Q9D0D5 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gtf2e1Q9D0D5 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gtf2e1Q9D0D5 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gtf2e1Q9D0D5 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gtf2e1Q9D0D5 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Gtf2e1Q9D0D5 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gtf2e1Q9D0D5 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gtf2e1Q9D0D5 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gtf2e1Q9D0D5 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gtf2e1Q9D0D5 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gtf2e1Q9D0D5 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Gtf2e1Q9D0D5 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gtf2e1Q9D0D5 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gtf2e1Q9D0D5 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gtf2e1Q9D0D5 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gtf2e1Q9D0D5 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gtf2e1Q9D0D5 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gtf2e1Q9D0D5 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gtf2e1Q9D0D5 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gtf2e1Q9D0D5 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gtf2e1Q9D0D5 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gtf2e1Q9D0D5 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gtf2e1Q9D0D5 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Gtf2e1Q9D0D5 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gtf2e1Q9D0D5 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Gtf2e1Q9D0D5 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Gtf2e1Q9D0D5 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Gtf2e1Q9D0D5 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Gtf2e1Q9D0D5 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Gtf2e1Q9D0D5 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gtf2e1Q9D0D5 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gtf2e1Q9D0D5 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gtf2e1Q9D0D5 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gtf2e1Q9D0D5 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gtf2e1Q9D0D5 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gtf2e1Q9D0D5 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gtf2e1Q9D0D5 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gtf2e1Q9D0D5 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gtf2e1Q9D0D5 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gtf2e1Q9D0D5 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Gtf2e1Q9D0D5 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gtf2e1Q9D0D5 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gtf2e1Q9D0D5 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gtf2e1Q9D0D5 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gtf2e1Q9D0D5 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gtf2e1Q9D0D5 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gtf2e1Q9D0D5 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Gtf2e1Q9D0D5 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gtf2e1Q9D0D5 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gtf2e1Q9D0D5 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gtf2e1Q9D0D5 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gtf2e1Q9D0D5 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gtf2e1Q9D0D5 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gtf2e1Q9D0D5 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gtf2e1Q9D0D5 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gtf2e1Q9D0D5 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gtf2e1Q9D0D5 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gtf2e1Q9D0D5 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gtf2e1Q9D0D5 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gtf2e1Q9D0D5 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gtf2e1Q9D0D5 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms