Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZH8

Ccdc77, Coiled-coil domain-containing protein 77, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc77Q9CZH8 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc77Q9CZH8 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc77Q9CZH8 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc77Q9CZH8 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc77Q9CZH8 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc77Q9CZH8 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc77Q9CZH8 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc77Q9CZH8 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc77Q9CZH8 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc77Q9CZH8 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc77Q9CZH8 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc77Q9CZH8 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc77Q9CZH8 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc77Q9CZH8 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc77Q9CZH8 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc77Q9CZH8 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc77Q9CZH8 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc77Q9CZH8 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc77Q9CZH8 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc77Q9CZH8 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc77Q9CZH8 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc77Q9CZH8 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc77Q9CZH8 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc77Q9CZH8 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc77Q9CZH8 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc77Q9CZH8 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc77Q9CZH8 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc77Q9CZH8 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc77Q9CZH8 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc77Q9CZH8 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc77Q9CZH8 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc77Q9CZH8 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc77Q9CZH8 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc77Q9CZH8 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc77Q9CZH8 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc77Q9CZH8 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc77Q9CZH8 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc77Q9CZH8 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc77Q9CZH8 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc77Q9CZH8 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc77Q9CZH8 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc77Q9CZH8 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc77Q9CZH8 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc77Q9CZH8 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc77Q9CZH8 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc77Q9CZH8 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc77Q9CZH8 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc77Q9CZH8 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc77Q9CZH8 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc77Q9CZH8 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc77Q9CZH8 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc77Q9CZH8 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc77Q9CZH8 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc77Q9CZH8 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc77Q9CZH8 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc77Q9CZH8 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc77Q9CZH8 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc77Q9CZH8 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc77Q9CZH8 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc77Q9CZH8 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc77Q9CZH8 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc77Q9CZH8 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc77Q9CZH8 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc77Q9CZH8 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc77Q9CZH8 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc77Q9CZH8 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc77Q9CZH8 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc77Q9CZH8 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc77Q9CZH8 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc77Q9CZH8 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc77Q9CZH8 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc77Q9CZH8 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc77Q9CZH8 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc77Q9CZH8 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc77Q9CZH8 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc77Q9CZH8 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc77Q9CZH8 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc77Q9CZH8 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc77Q9CZH8 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc77Q9CZH8 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc77Q9CZH8 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc77Q9CZH8 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc77Q9CZH8 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc77Q9CZH8 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc77Q9CZH8 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc77Q9CZH8 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc77Q9CZH8 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc77Q9CZH8 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc77Q9CZH8 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc77Q9CZH8 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc77Q9CZH8 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc77Q9CZH8 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc77Q9CZH8 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc77Q9CZH8 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc77Q9CZH8 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc77Q9CZH8 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc77Q9CZH8 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc77Q9CZH8 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc77Q9CZH8 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc77Q9CZH8 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms