Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ83

Mrpl55, 39S ribosomal protein L55, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl55Q9CZ83 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Mrpl55Q9CZ83 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Mrpl55Q9CZ83 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Mrpl55Q9CZ83 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Mrpl55Q9CZ83 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Mrpl55Q9CZ83 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Mrpl55Q9CZ83 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Mrpl55Q9CZ83 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Mrpl55Q9CZ83 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Mrpl55Q9CZ83 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Mrpl55Q9CZ83 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Mrpl55Q9CZ83 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Mrpl55Q9CZ83 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Mrpl55Q9CZ83 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Mrpl55Q9CZ83 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl55Q9CZ83 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl55Q9CZ83 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl55Q9CZ83 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl55Q9CZ83 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl55Q9CZ83 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl55Q9CZ83 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl55Q9CZ83 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl55Q9CZ83 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl55Q9CZ83 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl55Q9CZ83 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl55Q9CZ83 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl55Q9CZ83 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl55Q9CZ83 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl55Q9CZ83 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl55Q9CZ83 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl55Q9CZ83 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl55Q9CZ83 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl55Q9CZ83 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl55Q9CZ83 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl55Q9CZ83 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl55Q9CZ83 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl55Q9CZ83 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl55Q9CZ83 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl55Q9CZ83 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl55Q9CZ83 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl55Q9CZ83 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl55Q9CZ83 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl55Q9CZ83 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl55Q9CZ83 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl55Q9CZ83 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl55Q9CZ83 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl55Q9CZ83 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl55Q9CZ83 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl55Q9CZ83 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl55Q9CZ83 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl55Q9CZ83 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl55Q9CZ83 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl55Q9CZ83 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl55Q9CZ83 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl55Q9CZ83 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl55Q9CZ83 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl55Q9CZ83 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl55Q9CZ83 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl55Q9CZ83 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl55Q9CZ83 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl55Q9CZ83 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl55Q9CZ83 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl55Q9CZ83 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl55Q9CZ83 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms