Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ04

Cops7a, COP9 signalosome complex subunit 7a, mousemouse

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops7aQ9CZ04 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cops7aQ9CZ04 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cops7aQ9CZ04 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cops7aQ9CZ04 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cops7aQ9CZ04 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cops7aQ9CZ04 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cops7aQ9CZ04 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cops7aQ9CZ04 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cops7aQ9CZ04 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cops7aQ9CZ04 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cops7aQ9CZ04 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cops7aQ9CZ04 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cops7aQ9CZ04 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cops7aQ9CZ04 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cops7aQ9CZ04 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cops7aQ9CZ04 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cops7aQ9CZ04 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cops7aQ9CZ04 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cops7aQ9CZ04 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cops7aQ9CZ04 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cops7aQ9CZ04 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cops7aQ9CZ04 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cops7aQ9CZ04 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cops7aQ9CZ04 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cops7aQ9CZ04 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cops7aQ9CZ04 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cops7aQ9CZ04 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cops7aQ9CZ04 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cops7aQ9CZ04 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cops7aQ9CZ04 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cops7aQ9CZ04 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cops7aQ9CZ04 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cops7aQ9CZ04 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cops7aQ9CZ04 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cops7aQ9CZ04 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cops7aQ9CZ04 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cops7aQ9CZ04 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cops7aQ9CZ04 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cops7aQ9CZ04 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cops7aQ9CZ04 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cops7aQ9CZ04 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cops7aQ9CZ04 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cops7aQ9CZ04 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cops7aQ9CZ04 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Cops7aQ9CZ04 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cops7aQ9CZ04 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cops7aQ9CZ04 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cops7aQ9CZ04 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cops7aQ9CZ04 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cops7aQ9CZ04 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cops7aQ9CZ04 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cops7aQ9CZ04 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cops7aQ9CZ04 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cops7aQ9CZ04 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cops7aQ9CZ04 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cops7aQ9CZ04 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cops7aQ9CZ04 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cops7aQ9CZ04 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cops7aQ9CZ04 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cops7aQ9CZ04 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cops7aQ9CZ04 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Cops7aQ9CZ04 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cops7aQ9CZ04 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cops7aQ9CZ04 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cops7aQ9CZ04 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cops7aQ9CZ04 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cops7aQ9CZ04 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cops7aQ9CZ04 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cops7aQ9CZ04 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cops7aQ9CZ04 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cops7aQ9CZ04 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cops7aQ9CZ04 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cops7aQ9CZ04 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cops7aQ9CZ04 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cops7aQ9CZ04 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cops7aQ9CZ04 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cops7aQ9CZ04 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cops7aQ9CZ04 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cops7aQ9CZ04 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cops7aQ9CZ04 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cops7aQ9CZ04 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cops7aQ9CZ04 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cops7aQ9CZ04 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cops7aQ9CZ04 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cops7aQ9CZ04 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cops7aQ9CZ04 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cops7aQ9CZ04 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cops7aQ9CZ04 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cops7aQ9CZ04 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cops7aQ9CZ04 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cops7aQ9CZ04 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cops7aQ9CZ04 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cops7aQ9CZ04 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cops7aQ9CZ04 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cops7aQ9CZ04 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cops7aQ9CZ04 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cops7aQ9CZ04 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cops7aQ9CZ04 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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