Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY97

Ssu72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssu72Q9CY97 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ssu72Q9CY97 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ssu72Q9CY97 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ssu72Q9CY97 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ssu72Q9CY97 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ssu72Q9CY97 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ssu72Q9CY97 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ssu72Q9CY97 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ssu72Q9CY97 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ssu72Q9CY97 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ssu72Q9CY97 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ssu72Q9CY97 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ssu72Q9CY97 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ssu72Q9CY97 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ssu72Q9CY97 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ssu72Q9CY97 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ssu72Q9CY97 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ssu72Q9CY97 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ssu72Q9CY97 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ssu72Q9CY97 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ssu72Q9CY97 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ssu72Q9CY97 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ssu72Q9CY97 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ssu72Q9CY97 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ssu72Q9CY97 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ssu72Q9CY97 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ssu72Q9CY97 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ssu72Q9CY97 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ssu72Q9CY97 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ssu72Q9CY97 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ssu72Q9CY97 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ssu72Q9CY97 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ssu72Q9CY97 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ssu72Q9CY97 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ssu72Q9CY97 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ssu72Q9CY97 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ssu72Q9CY97 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ssu72Q9CY97 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ssu72Q9CY97 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ssu72Q9CY97 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ssu72Q9CY97 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ssu72Q9CY97 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ssu72Q9CY97 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ssu72Q9CY97 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ssu72Q9CY97 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ssu72Q9CY97 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ssu72Q9CY97 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ssu72Q9CY97 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ssu72Q9CY97 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ssu72Q9CY97 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ssu72Q9CY97 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ssu72Q9CY97 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ssu72Q9CY97 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ssu72Q9CY97 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ssu72Q9CY97 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ssu72Q9CY97 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ssu72Q9CY97 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ssu72Q9CY97 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ssu72Q9CY97 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ssu72Q9CY97 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ssu72Q9CY97 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ssu72Q9CY97 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ssu72Q9CY97 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ssu72Q9CY97 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ssu72Q9CY97 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ssu72Q9CY97 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ssu72Q9CY97 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ssu72Q9CY97 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ssu72Q9CY97 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ssu72Q9CY97 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ssu72Q9CY97 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ssu72Q9CY97 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ssu72Q9CY97 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ssu72Q9CY97 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ssu72Q9CY97 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ssu72Q9CY97 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ssu72Q9CY97 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ssu72Q9CY97 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ssu72Q9CY97 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ssu72Q9CY97 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ssu72Q9CY97 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ssu72Q9CY97 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ssu72Q9CY97 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ssu72Q9CY97 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ssu72Q9CY97 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ssu72Q9CY97 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ssu72Q9CY97 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ssu72Q9CY97 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ssu72Q9CY97 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ssu72Q9CY97 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ssu72Q9CY97 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ssu72Q9CY97 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ssu72Q9CY97 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ssu72Q9CY97 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ssu72Q9CY97 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ssu72Q9CY97 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ssu72Q9CY97 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ssu72Q9CY97 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ssu72Q9CY97 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ssu72Q9CY97 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms