Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX97

Wdr55, WD repeat-containing protein 55, mousemouse

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr55Q9CX97 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Wdr55Q9CX97 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Wdr55Q9CX97 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Wdr55Q9CX97 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Wdr55Q9CX97 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Wdr55Q9CX97 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Wdr55Q9CX97 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Wdr55Q9CX97 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Wdr55Q9CX97 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Wdr55Q9CX97 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Wdr55Q9CX97 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Wdr55Q9CX97 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Wdr55Q9CX97 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Wdr55Q9CX97 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Wdr55Q9CX97 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Wdr55Q9CX97 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Wdr55Q9CX97 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Wdr55Q9CX97 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Wdr55Q9CX97 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Wdr55Q9CX97 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Wdr55Q9CX97 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Wdr55Q9CX97 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Wdr55Q9CX97 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Wdr55Q9CX97 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Wdr55Q9CX97 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Wdr55Q9CX97 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Wdr55Q9CX97 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Wdr55Q9CX97 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Wdr55Q9CX97 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Wdr55Q9CX97 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Wdr55Q9CX97 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Wdr55Q9CX97 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Wdr55Q9CX97 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Wdr55Q9CX97 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Wdr55Q9CX97 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Wdr55Q9CX97 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Wdr55Q9CX97 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Wdr55Q9CX97 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Wdr55Q9CX97 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Wdr55Q9CX97 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Wdr55Q9CX97 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Wdr55Q9CX97 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Wdr55Q9CX97 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Wdr55Q9CX97 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Wdr55Q9CX97 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Wdr55Q9CX97 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Wdr55Q9CX97 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Wdr55Q9CX97 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Wdr55Q9CX97 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Wdr55Q9CX97 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Wdr55Q9CX97 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Wdr55Q9CX97 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Wdr55Q9CX97 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Wdr55Q9CX97 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Wdr55Q9CX97 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Wdr55Q9CX97 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Wdr55Q9CX97 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Wdr55Q9CX97 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Wdr55Q9CX97 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Wdr55Q9CX97 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Wdr55Q9CX97 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Wdr55Q9CX97 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Wdr55Q9CX97 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Wdr55Q9CX97 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Wdr55Q9CX97 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Wdr55Q9CX97 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Wdr55Q9CX97 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Wdr55Q9CX97 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Wdr55Q9CX97 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Wdr55Q9CX97 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Wdr55Q9CX97 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Wdr55Q9CX97 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Wdr55Q9CX97 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Wdr55Q9CX97 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Wdr55Q9CX97 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Wdr55Q9CX97 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Wdr55Q9CX97 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Wdr55Q9CX97 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Wdr55Q9CX97 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Wdr55Q9CX97 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Wdr55Q9CX97 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Wdr55Q9CX97 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Wdr55Q9CX97 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Wdr55Q9CX97 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Wdr55Q9CX97 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Wdr55Q9CX97 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Wdr55Q9CX97 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Wdr55Q9CX97 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Wdr55Q9CX97 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Wdr55Q9CX97 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Wdr55Q9CX97 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Wdr55Q9CX97 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Wdr55Q9CX97 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Wdr55Q9CX97 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Wdr55Q9CX97 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Wdr55Q9CX97 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Wdr55Q9CX97 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Wdr55Q9CX97 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Wdr55Q9CX97 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Wdr55Q9CX97 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms