Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX56

Psmd8, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd8Q9CX56 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Psmd8Q9CX56 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psmd8Q9CX56 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Psmd8Q9CX56 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psmd8Q9CX56 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psmd8Q9CX56 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psmd8Q9CX56 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psmd8Q9CX56 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Psmd8Q9CX56 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psmd8Q9CX56 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Psmd8Q9CX56 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psmd8Q9CX56 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psmd8Q9CX56 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psmd8Q9CX56 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psmd8Q9CX56 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psmd8Q9CX56 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psmd8Q9CX56 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psmd8Q9CX56 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psmd8Q9CX56 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Psmd8Q9CX56 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Psmd8Q9CX56 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Psmd8Q9CX56 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Psmd8Q9CX56 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Psmd8Q9CX56 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Psmd8Q9CX56 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ 0
Psmd8Q9CX56 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Psmd8Q9CX56 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Psmd8Q9CX56 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Psmd8Q9CX56 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Psmd8Q9CX56 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Psmd8Q9CX56 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Psmd8Q9CX56 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Psmd8Q9CX56 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Psmd8Q9CX56 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Psmd8Q9CX56 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Psmd8Q9CX56 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Psmd8Q9CX56 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Psmd8Q9CX56 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Psmd8Q9CX56 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Psmd8Q9CX56 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Psmd8Q9CX56 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Psmd8Q9CX56 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Psmd8Q9CX56 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Psmd8Q9CX56 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Psmd8Q9CX56 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Psmd8Q9CX56 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Psmd8Q9CX56 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Psmd8Q9CX56 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psmd8Q9CX56 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psmd8Q9CX56 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psmd8Q9CX56 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psmd8Q9CX56 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Psmd8Q9CX56 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psmd8Q9CX56 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psmd8Q9CX56 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Psmd8Q9CX56 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psmd8Q9CX56 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psmd8Q9CX56 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Psmd8Q9CX56 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Psmd8Q9CX56 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psmd8Q9CX56 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psmd8Q9CX56 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psmd8Q9CX56 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psmd8Q9CX56 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Psmd8Q9CX56 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psmd8Q9CX56 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Psmd8Q9CX56 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Psmd8Q9CX56 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psmd8Q9CX56 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psmd8Q9CX56 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psmd8Q9CX56 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psmd8Q9CX56 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psmd8Q9CX56 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Psmd8Q9CX56 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Psmd8Q9CX56 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Psmd8Q9CX56 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Psmd8Q9CX56 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Psmd8Q9CX56 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Psmd8Q9CX56 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Psmd8Q9CX56 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Psmd8Q9CX56 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Psmd8Q9CX56 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Psmd8Q9CX56 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Psmd8Q9CX56 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Psmd8Q9CX56 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Psmd8Q9CX56 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Psmd8Q9CX56 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Psmd8Q9CX56 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Psmd8Q9CX56 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Psmd8Q9CX56 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Psmd8Q9CX56 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Psmd8Q9CX56 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Psmd8Q9CX56 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Psmd8Q9CX56 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Psmd8Q9CX56 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Psmd8Q9CX56 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Psmd8Q9CX56 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Psmd8Q9CX56 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Psmd8Q9CX56 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Psmd8Q9CX56 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms