Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX00

Ist1, IST1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ist1Q9CX00 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ist1Q9CX00 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ist1Q9CX00 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ist1Q9CX00 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ist1Q9CX00 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ist1Q9CX00 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ist1Q9CX00 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ist1Q9CX00 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ist1Q9CX00 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ist1Q9CX00 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ist1Q9CX00 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ist1Q9CX00 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ist1Q9CX00 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ist1Q9CX00 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ist1Q9CX00 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ist1Q9CX00 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ist1Q9CX00 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ist1Q9CX00 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ist1Q9CX00 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ist1Q9CX00 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ist1Q9CX00 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ist1Q9CX00 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ist1Q9CX00 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ist1Q9CX00 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ist1Q9CX00 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ist1Q9CX00 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ist1Q9CX00 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ist1Q9CX00 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ist1Q9CX00 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ist1Q9CX00 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ist1Q9CX00 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ist1Q9CX00 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ist1Q9CX00 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ist1Q9CX00 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ist1Q9CX00 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ist1Q9CX00 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ist1Q9CX00 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ist1Q9CX00 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ist1Q9CX00 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ist1Q9CX00 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ist1Q9CX00 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ist1Q9CX00 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ist1Q9CX00 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ist1Q9CX00 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ist1Q9CX00 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ist1Q9CX00 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ist1Q9CX00 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ist1Q9CX00 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ist1Q9CX00 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ist1Q9CX00 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ist1Q9CX00 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ist1Q9CX00 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ist1Q9CX00 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ist1Q9CX00 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ist1Q9CX00 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ist1Q9CX00 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ist1Q9CX00 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ist1Q9CX00 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ist1Q9CX00 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ist1Q9CX00 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ist1Q9CX00 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ist1Q9CX00 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ist1Q9CX00 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ist1Q9CX00 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ist1Q9CX00 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ist1Q9CX00 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ist1Q9CX00 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ist1Q9CX00 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ist1Q9CX00 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ist1Q9CX00 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ist1Q9CX00 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ist1Q9CX00 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ist1Q9CX00 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ist1Q9CX00 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ist1Q9CX00 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ist1Q9CX00 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ist1Q9CX00 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ist1Q9CX00 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ist1Q9CX00 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ist1Q9CX00 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ist1Q9CX00 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ist1Q9CX00 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ist1Q9CX00 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ist1Q9CX00 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ist1Q9CX00 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ist1Q9CX00 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ist1Q9CX00 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ist1Q9CX00 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ist1Q9CX00 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ist1Q9CX00 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ist1Q9CX00 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ist1Q9CX00 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ist1Q9CX00 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ist1Q9CX00 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ist1Q9CX00 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ist1Q9CX00 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ist1Q9CX00 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ist1Q9CX00 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ist1Q9CX00 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ist1Q9CX00 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms