Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV0

Malsu1, Mitochondrial assembly of ribosomal large subunit protein 1, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Malsu1Q9CWV0 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Malsu1Q9CWV0 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Malsu1Q9CWV0 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Malsu1Q9CWV0 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Malsu1Q9CWV0 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Malsu1Q9CWV0 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Malsu1Q9CWV0 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Malsu1Q9CWV0 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Malsu1Q9CWV0 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Malsu1Q9CWV0 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Malsu1Q9CWV0 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Malsu1Q9CWV0 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Malsu1Q9CWV0 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Malsu1Q9CWV0 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Malsu1Q9CWV0 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Malsu1Q9CWV0 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Malsu1Q9CWV0 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Malsu1Q9CWV0 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Malsu1Q9CWV0 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Malsu1Q9CWV0 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Malsu1Q9CWV0 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Malsu1Q9CWV0 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Malsu1Q9CWV0 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Malsu1Q9CWV0 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Malsu1Q9CWV0 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Malsu1Q9CWV0 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Malsu1Q9CWV0 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Malsu1Q9CWV0 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Malsu1Q9CWV0 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Malsu1Q9CWV0 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Malsu1Q9CWV0 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Malsu1Q9CWV0 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Malsu1Q9CWV0 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Malsu1Q9CWV0 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Malsu1Q9CWV0 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Malsu1Q9CWV0 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Malsu1Q9CWV0 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Malsu1Q9CWV0 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Malsu1Q9CWV0 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Malsu1Q9CWV0 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Malsu1Q9CWV0 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Malsu1Q9CWV0 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Malsu1Q9CWV0 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Malsu1Q9CWV0 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Malsu1Q9CWV0 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Malsu1Q9CWV0 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Malsu1Q9CWV0 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Malsu1Q9CWV0 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Malsu1Q9CWV0 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Malsu1Q9CWV0 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Malsu1Q9CWV0 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Malsu1Q9CWV0 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Malsu1Q9CWV0 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Malsu1Q9CWV0 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Malsu1Q9CWV0 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Malsu1Q9CWV0 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Malsu1Q9CWV0 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Malsu1Q9CWV0 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Malsu1Q9CWV0 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Malsu1Q9CWV0 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Malsu1Q9CWV0 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Malsu1Q9CWV0 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Malsu1Q9CWV0 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Malsu1Q9CWV0 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Malsu1Q9CWV0 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Malsu1Q9CWV0 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Malsu1Q9CWV0 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Malsu1Q9CWV0 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Malsu1Q9CWV0 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Malsu1Q9CWV0 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Malsu1Q9CWV0 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Malsu1Q9CWV0 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Malsu1Q9CWV0 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Malsu1Q9CWV0 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Malsu1Q9CWV0 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Malsu1Q9CWV0 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Malsu1Q9CWV0 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Malsu1Q9CWV0 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Malsu1Q9CWV0 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Malsu1Q9CWV0 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Malsu1Q9CWV0 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Malsu1Q9CWV0 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Malsu1Q9CWV0 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Malsu1Q9CWV0 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Malsu1Q9CWV0 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Malsu1Q9CWV0 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Malsu1Q9CWV0 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Malsu1Q9CWV0 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Malsu1Q9CWV0 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Malsu1Q9CWV0 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Malsu1Q9CWV0 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Malsu1Q9CWV0 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Malsu1Q9CWV0 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Malsu1Q9CWV0 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Malsu1Q9CWV0 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Malsu1Q9CWV0 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Malsu1Q9CWV0 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Malsu1Q9CWV0 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Malsu1Q9CWV0 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Malsu1Q9CWV0 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms