Protein–RNA interactions for Protein: Q9CVR1

Gm26657, Predicted gene, 26657 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm26657Q9CVR1 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm26657Q9CVR1 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm26657Q9CVR1 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm26657Q9CVR1 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm26657Q9CVR1 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm26657Q9CVR1 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm26657Q9CVR1 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm26657Q9CVR1 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm26657Q9CVR1 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm26657Q9CVR1 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm26657Q9CVR1 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm26657Q9CVR1 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm26657Q9CVR1 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm26657Q9CVR1 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm26657Q9CVR1 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm26657Q9CVR1 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm26657Q9CVR1 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm26657Q9CVR1 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm26657Q9CVR1 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm26657Q9CVR1 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm26657Q9CVR1 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm26657Q9CVR1 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm26657Q9CVR1 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm26657Q9CVR1 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm26657Q9CVR1 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm26657Q9CVR1 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm26657Q9CVR1 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm26657Q9CVR1 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm26657Q9CVR1 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm26657Q9CVR1 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm26657Q9CVR1 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm26657Q9CVR1 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm26657Q9CVR1 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm26657Q9CVR1 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm26657Q9CVR1 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm26657Q9CVR1 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm26657Q9CVR1 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm26657Q9CVR1 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm26657Q9CVR1 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm26657Q9CVR1 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm26657Q9CVR1 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm26657Q9CVR1 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm26657Q9CVR1 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm26657Q9CVR1 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm26657Q9CVR1 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm26657Q9CVR1 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm26657Q9CVR1 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm26657Q9CVR1 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm26657Q9CVR1 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm26657Q9CVR1 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm26657Q9CVR1 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm26657Q9CVR1 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm26657Q9CVR1 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm26657Q9CVR1 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm26657Q9CVR1 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm26657Q9CVR1 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm26657Q9CVR1 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm26657Q9CVR1 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm26657Q9CVR1 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm26657Q9CVR1 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm26657Q9CVR1 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm26657Q9CVR1 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm26657Q9CVR1 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm26657Q9CVR1 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm26657Q9CVR1 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm26657Q9CVR1 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm26657Q9CVR1 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm26657Q9CVR1 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm26657Q9CVR1 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm26657Q9CVR1 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm26657Q9CVR1 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm26657Q9CVR1 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm26657Q9CVR1 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm26657Q9CVR1 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm26657Q9CVR1 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm26657Q9CVR1 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm26657Q9CVR1 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm26657Q9CVR1 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm26657Q9CVR1 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm26657Q9CVR1 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm26657Q9CVR1 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm26657Q9CVR1 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm26657Q9CVR1 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm26657Q9CVR1 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm26657Q9CVR1 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm26657Q9CVR1 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm26657Q9CVR1 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm26657Q9CVR1 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm26657Q9CVR1 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm26657Q9CVR1 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm26657Q9CVR1 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm26657Q9CVR1 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm26657Q9CVR1 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm26657Q9CVR1 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm26657Q9CVR1 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm26657Q9CVR1 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm26657Q9CVR1 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm26657Q9CVR1 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm26657Q9CVR1 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm26657Q9CVR1 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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