Protein–RNA interactions for Protein: Q9CV28

MINDY3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-3, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MINDY3Q9CV28 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MINDY3Q9CV28 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MINDY3Q9CV28 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MINDY3Q9CV28 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MINDY3Q9CV28 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MINDY3Q9CV28 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MINDY3Q9CV28 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MINDY3Q9CV28 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MINDY3Q9CV28 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MINDY3Q9CV28 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MINDY3Q9CV28 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MINDY3Q9CV28 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MINDY3Q9CV28 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MINDY3Q9CV28 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MINDY3Q9CV28 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MINDY3Q9CV28 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MINDY3Q9CV28 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MINDY3Q9CV28 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MINDY3Q9CV28 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
MINDY3Q9CV28 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MINDY3Q9CV28 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MINDY3Q9CV28 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MINDY3Q9CV28 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MINDY3Q9CV28 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MINDY3Q9CV28 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MINDY3Q9CV28 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MINDY3Q9CV28 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MINDY3Q9CV28 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MINDY3Q9CV28 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MINDY3Q9CV28 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MINDY3Q9CV28 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MINDY3Q9CV28 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MINDY3Q9CV28 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MINDY3Q9CV28 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MINDY3Q9CV28 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MINDY3Q9CV28 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MINDY3Q9CV28 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MINDY3Q9CV28 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MINDY3Q9CV28 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MINDY3Q9CV28 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MINDY3Q9CV28 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MINDY3Q9CV28 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MINDY3Q9CV28 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MINDY3Q9CV28 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MINDY3Q9CV28 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MINDY3Q9CV28 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MINDY3Q9CV28 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MINDY3Q9CV28 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MINDY3Q9CV28 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MINDY3Q9CV28 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MINDY3Q9CV28 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MINDY3Q9CV28 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MINDY3Q9CV28 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MINDY3Q9CV28 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MINDY3Q9CV28 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MINDY3Q9CV28 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MINDY3Q9CV28 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MINDY3Q9CV28 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MINDY3Q9CV28 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MINDY3Q9CV28 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MINDY3Q9CV28 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MINDY3Q9CV28 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MINDY3Q9CV28 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MINDY3Q9CV28 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MINDY3Q9CV28 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MINDY3Q9CV28 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MINDY3Q9CV28 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MINDY3Q9CV28 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MINDY3Q9CV28 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MINDY3Q9CV28 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MINDY3Q9CV28 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MINDY3Q9CV28 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MINDY3Q9CV28 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MINDY3Q9CV28 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MINDY3Q9CV28 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MINDY3Q9CV28 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MINDY3Q9CV28 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MINDY3Q9CV28 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MINDY3Q9CV28 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MINDY3Q9CV28 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MINDY3Q9CV28 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
MINDY3Q9CV28 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
MINDY3Q9CV28 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MINDY3Q9CV28 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MINDY3Q9CV28 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MINDY3Q9CV28 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MINDY3Q9CV28 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MINDY3Q9CV28 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MINDY3Q9CV28 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MINDY3Q9CV28 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MINDY3Q9CV28 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MINDY3Q9CV28 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MINDY3Q9CV28 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MINDY3Q9CV28 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MINDY3Q9CV28 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MINDY3Q9CV28 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MINDY3Q9CV28 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MINDY3Q9CV28 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MINDY3Q9CV28 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MINDY3Q9CV28 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms