Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUU3

Sycp2, Synaptonemal complex protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp2Q9CUU3 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Sycp2Q9CUU3 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Sycp2Q9CUU3 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Sycp2Q9CUU3 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Sycp2Q9CUU3 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Sycp2Q9CUU3 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Sycp2Q9CUU3 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Sycp2Q9CUU3 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Sycp2Q9CUU3 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Sycp2Q9CUU3 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Sycp2Q9CUU3 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Sycp2Q9CUU3 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Sycp2Q9CUU3 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Sycp2Q9CUU3 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Sycp2Q9CUU3 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Sycp2Q9CUU3 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Sycp2Q9CUU3 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Sycp2Q9CUU3 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Sycp2Q9CUU3 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Sycp2Q9CUU3 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Sycp2Q9CUU3 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Sycp2Q9CUU3 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Sycp2Q9CUU3 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Sycp2Q9CUU3 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Sycp2Q9CUU3 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Sycp2Q9CUU3 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Sycp2Q9CUU3 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Sycp2Q9CUU3 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Sycp2Q9CUU3 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Sycp2Q9CUU3 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Sycp2Q9CUU3 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Sycp2Q9CUU3 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Sycp2Q9CUU3 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Sycp2Q9CUU3 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Sycp2Q9CUU3 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.16
Sycp2Q9CUU3 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC28.51■■■□□ 2.16
Sycp2Q9CUU3 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Sycp2Q9CUU3 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Sycp2Q9CUU3 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Sycp2Q9CUU3 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Sycp2Q9CUU3 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Sycp2Q9CUU3 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Sycp2Q9CUU3 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Sycp2Q9CUU3 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Sycp2Q9CUU3 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Sycp2Q9CUU3 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Sycp2Q9CUU3 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Sycp2Q9CUU3 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Sycp2Q9CUU3 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Sycp2Q9CUU3 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Sycp2Q9CUU3 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Sycp2Q9CUU3 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Sycp2Q9CUU3 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Sycp2Q9CUU3 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Sycp2Q9CUU3 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Sycp2Q9CUU3 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Sycp2Q9CUU3 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Sycp2Q9CUU3 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Sycp2Q9CUU3 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Sycp2Q9CUU3 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Sycp2Q9CUU3 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Sycp2Q9CUU3 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Sycp2Q9CUU3 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Sycp2Q9CUU3 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Sycp2Q9CUU3 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Sycp2Q9CUU3 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Sycp2Q9CUU3 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Sycp2Q9CUU3 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Sycp2Q9CUU3 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Sycp2Q9CUU3 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Sycp2Q9CUU3 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Sycp2Q9CUU3 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Sycp2Q9CUU3 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Sycp2Q9CUU3 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Sycp2Q9CUU3 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Sycp2Q9CUU3 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Sycp2Q9CUU3 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Sycp2Q9CUU3 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Sycp2Q9CUU3 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Sycp2Q9CUU3 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Sycp2Q9CUU3 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Sycp2Q9CUU3 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Sycp2Q9CUU3 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Sycp2Q9CUU3 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Sycp2Q9CUU3 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Sycp2Q9CUU3 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Sycp2Q9CUU3 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Sycp2Q9CUU3 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Sycp2Q9CUU3 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Sycp2Q9CUU3 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Sycp2Q9CUU3 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Sycp2Q9CUU3 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Sycp2Q9CUU3 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Sycp2Q9CUU3 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Sycp2Q9CUU3 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Sycp2Q9CUU3 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Sycp2Q9CUU3 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Sycp2Q9CUU3 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Sycp2Q9CUU3 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Sycp2Q9CUU3 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms