Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRC9

Gnpda2, Glucosamine-6-phosphate isomerase 2, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gnpda2Q9CRC9 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gnpda2Q9CRC9 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gnpda2Q9CRC9 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gnpda2Q9CRC9 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gnpda2Q9CRC9 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gnpda2Q9CRC9 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gnpda2Q9CRC9 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gnpda2Q9CRC9 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Gnpda2Q9CRC9 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Gnpda2Q9CRC9 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Gnpda2Q9CRC9 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Gnpda2Q9CRC9 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gnpda2Q9CRC9 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Gnpda2Q9CRC9 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gnpda2Q9CRC9 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Gnpda2Q9CRC9 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gnpda2Q9CRC9 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Gnpda2Q9CRC9 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gnpda2Q9CRC9 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gnpda2Q9CRC9 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gnpda2Q9CRC9 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gnpda2Q9CRC9 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gnpda2Q9CRC9 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gnpda2Q9CRC9 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gnpda2Q9CRC9 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gnpda2Q9CRC9 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gnpda2Q9CRC9 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gnpda2Q9CRC9 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gnpda2Q9CRC9 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gnpda2Q9CRC9 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gnpda2Q9CRC9 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gnpda2Q9CRC9 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gnpda2Q9CRC9 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gnpda2Q9CRC9 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gnpda2Q9CRC9 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gnpda2Q9CRC9 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gnpda2Q9CRC9 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gnpda2Q9CRC9 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gnpda2Q9CRC9 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gnpda2Q9CRC9 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gnpda2Q9CRC9 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gnpda2Q9CRC9 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gnpda2Q9CRC9 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gnpda2Q9CRC9 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gnpda2Q9CRC9 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gnpda2Q9CRC9 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gnpda2Q9CRC9 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gnpda2Q9CRC9 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gnpda2Q9CRC9 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gnpda2Q9CRC9 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gnpda2Q9CRC9 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gnpda2Q9CRC9 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gnpda2Q9CRC9 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gnpda2Q9CRC9 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gnpda2Q9CRC9 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gnpda2Q9CRC9 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gnpda2Q9CRC9 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gnpda2Q9CRC9 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gnpda2Q9CRC9 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gnpda2Q9CRC9 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gnpda2Q9CRC9 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gnpda2Q9CRC9 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gnpda2Q9CRC9 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Gnpda2Q9CRC9 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gnpda2Q9CRC9 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gnpda2Q9CRC9 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gnpda2Q9CRC9 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gnpda2Q9CRC9 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gnpda2Q9CRC9 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gnpda2Q9CRC9 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gnpda2Q9CRC9 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gnpda2Q9CRC9 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gnpda2Q9CRC9 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gnpda2Q9CRC9 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gnpda2Q9CRC9 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gnpda2Q9CRC9 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gnpda2Q9CRC9 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gnpda2Q9CRC9 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gnpda2Q9CRC9 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gnpda2Q9CRC9 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gnpda2Q9CRC9 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gnpda2Q9CRC9 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gnpda2Q9CRC9 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gnpda2Q9CRC9 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gnpda2Q9CRC9 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gnpda2Q9CRC9 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gnpda2Q9CRC9 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gnpda2Q9CRC9 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gnpda2Q9CRC9 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gnpda2Q9CRC9 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gnpda2Q9CRC9 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gnpda2Q9CRC9 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gnpda2Q9CRC9 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gnpda2Q9CRC9 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gnpda2Q9CRC9 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gnpda2Q9CRC9 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gnpda2Q9CRC9 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gnpda2Q9CRC9 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gnpda2Q9CRC9 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gnpda2Q9CRC9 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms