Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRB4

1700029F12Rik, RIKEN cDNA 1700029F12 gene, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029F12RikQ9CRB4 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
1700029F12RikQ9CRB4 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
1700029F12RikQ9CRB4 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
1700029F12RikQ9CRB4 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
1700029F12RikQ9CRB4 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
1700029F12RikQ9CRB4 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
1700029F12RikQ9CRB4 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
1700029F12RikQ9CRB4 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
1700029F12RikQ9CRB4 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
1700029F12RikQ9CRB4 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
1700029F12RikQ9CRB4 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
1700029F12RikQ9CRB4 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
1700029F12RikQ9CRB4 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
1700029F12RikQ9CRB4 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
1700029F12RikQ9CRB4 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
1700029F12RikQ9CRB4 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
1700029F12RikQ9CRB4 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
1700029F12RikQ9CRB4 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
1700029F12RikQ9CRB4 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
1700029F12RikQ9CRB4 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
1700029F12RikQ9CRB4 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
1700029F12RikQ9CRB4 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
1700029F12RikQ9CRB4 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
1700029F12RikQ9CRB4 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
1700029F12RikQ9CRB4 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
1700029F12RikQ9CRB4 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
1700029F12RikQ9CRB4 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
1700029F12RikQ9CRB4 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
1700029F12RikQ9CRB4 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
1700029F12RikQ9CRB4 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
1700029F12RikQ9CRB4 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
1700029F12RikQ9CRB4 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
1700029F12RikQ9CRB4 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
1700029F12RikQ9CRB4 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
1700029F12RikQ9CRB4 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
1700029F12RikQ9CRB4 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
1700029F12RikQ9CRB4 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
1700029F12RikQ9CRB4 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
1700029F12RikQ9CRB4 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
1700029F12RikQ9CRB4 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
1700029F12RikQ9CRB4 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
1700029F12RikQ9CRB4 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
1700029F12RikQ9CRB4 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
1700029F12RikQ9CRB4 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
1700029F12RikQ9CRB4 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
1700029F12RikQ9CRB4 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
1700029F12RikQ9CRB4 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
1700029F12RikQ9CRB4 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
1700029F12RikQ9CRB4 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
1700029F12RikQ9CRB4 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
1700029F12RikQ9CRB4 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
1700029F12RikQ9CRB4 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
1700029F12RikQ9CRB4 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
1700029F12RikQ9CRB4 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
1700029F12RikQ9CRB4 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
1700029F12RikQ9CRB4 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
1700029F12RikQ9CRB4 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
1700029F12RikQ9CRB4 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
1700029F12RikQ9CRB4 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
1700029F12RikQ9CRB4 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
1700029F12RikQ9CRB4 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
1700029F12RikQ9CRB4 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
1700029F12RikQ9CRB4 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
1700029F12RikQ9CRB4 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
1700029F12RikQ9CRB4 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
1700029F12RikQ9CRB4 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
1700029F12RikQ9CRB4 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
1700029F12RikQ9CRB4 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
1700029F12RikQ9CRB4 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
1700029F12RikQ9CRB4 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
1700029F12RikQ9CRB4 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
1700029F12RikQ9CRB4 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
1700029F12RikQ9CRB4 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
1700029F12RikQ9CRB4 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
1700029F12RikQ9CRB4 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
1700029F12RikQ9CRB4 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
1700029F12RikQ9CRB4 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
1700029F12RikQ9CRB4 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
1700029F12RikQ9CRB4 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
1700029F12RikQ9CRB4 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
1700029F12RikQ9CRB4 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
1700029F12RikQ9CRB4 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
1700029F12RikQ9CRB4 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
1700029F12RikQ9CRB4 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
1700029F12RikQ9CRB4 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
1700029F12RikQ9CRB4 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
1700029F12RikQ9CRB4 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
1700029F12RikQ9CRB4 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
1700029F12RikQ9CRB4 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
1700029F12RikQ9CRB4 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
1700029F12RikQ9CRB4 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
1700029F12RikQ9CRB4 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
1700029F12RikQ9CRB4 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
1700029F12RikQ9CRB4 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
1700029F12RikQ9CRB4 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
1700029F12RikQ9CRB4 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
1700029F12RikQ9CRB4 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
1700029F12RikQ9CRB4 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
1700029F12RikQ9CRB4 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
1700029F12RikQ9CRB4 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms