Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ8

Lsm7, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 103 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm7Q9CQQ8 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lsm7Q9CQQ8 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lsm7Q9CQQ8 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Lsm7Q9CQQ8 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Lsm7Q9CQQ8 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lsm7Q9CQQ8 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lsm7Q9CQQ8 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Lsm7Q9CQQ8 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lsm7Q9CQQ8 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lsm7Q9CQQ8 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lsm7Q9CQQ8 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lsm7Q9CQQ8 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lsm7Q9CQQ8 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lsm7Q9CQQ8 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lsm7Q9CQQ8 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lsm7Q9CQQ8 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lsm7Q9CQQ8 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lsm7Q9CQQ8 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lsm7Q9CQQ8 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lsm7Q9CQQ8 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lsm7Q9CQQ8 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lsm7Q9CQQ8 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lsm7Q9CQQ8 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lsm7Q9CQQ8 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lsm7Q9CQQ8 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lsm7Q9CQQ8 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lsm7Q9CQQ8 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lsm7Q9CQQ8 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lsm7Q9CQQ8 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lsm7Q9CQQ8 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lsm7Q9CQQ8 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lsm7Q9CQQ8 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lsm7Q9CQQ8 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lsm7Q9CQQ8 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lsm7Q9CQQ8 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lsm7Q9CQQ8 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lsm7Q9CQQ8 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Lsm7Q9CQQ8 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lsm7Q9CQQ8 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lsm7Q9CQQ8 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lsm7Q9CQQ8 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lsm7Q9CQQ8 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lsm7Q9CQQ8 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lsm7Q9CQQ8 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Lsm7Q9CQQ8 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lsm7Q9CQQ8 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lsm7Q9CQQ8 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lsm7Q9CQQ8 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lsm7Q9CQQ8 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lsm7Q9CQQ8 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lsm7Q9CQQ8 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lsm7Q9CQQ8 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lsm7Q9CQQ8 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lsm7Q9CQQ8 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lsm7Q9CQQ8 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lsm7Q9CQQ8 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lsm7Q9CQQ8 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lsm7Q9CQQ8 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lsm7Q9CQQ8 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lsm7Q9CQQ8 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lsm7Q9CQQ8 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lsm7Q9CQQ8 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lsm7Q9CQQ8 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lsm7Q9CQQ8 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lsm7Q9CQQ8 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lsm7Q9CQQ8 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lsm7Q9CQQ8 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lsm7Q9CQQ8 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lsm7Q9CQQ8 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lsm7Q9CQQ8 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lsm7Q9CQQ8 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lsm7Q9CQQ8 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Lsm7Q9CQQ8 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lsm7Q9CQQ8 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lsm7Q9CQQ8 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lsm7Q9CQQ8 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lsm7Q9CQQ8 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Lsm7Q9CQQ8 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lsm7Q9CQQ8 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lsm7Q9CQQ8 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lsm7Q9CQQ8 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lsm7Q9CQQ8 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lsm7Q9CQQ8 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lsm7Q9CQQ8 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lsm7Q9CQQ8 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lsm7Q9CQQ8 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lsm7Q9CQQ8 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lsm7Q9CQQ8 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lsm7Q9CQQ8 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lsm7Q9CQQ8 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lsm7Q9CQQ8 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lsm7Q9CQQ8 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lsm7Q9CQQ8 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Lsm7Q9CQQ8 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lsm7Q9CQQ8 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lsm7Q9CQQ8 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lsm7Q9CQQ8 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lsm7Q9CQQ8 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Lsm7Q9CQQ8 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lsm7Q9CQQ8 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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