Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ8

Ndufb9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb9Q9CQJ8 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ndufb9Q9CQJ8 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ndufb9Q9CQJ8 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ndufb9Q9CQJ8 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ndufb9Q9CQJ8 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ndufb9Q9CQJ8 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ndufb9Q9CQJ8 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ndufb9Q9CQJ8 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ndufb9Q9CQJ8 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ndufb9Q9CQJ8 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ndufb9Q9CQJ8 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ndufb9Q9CQJ8 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ndufb9Q9CQJ8 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ndufb9Q9CQJ8 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ndufb9Q9CQJ8 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ndufb9Q9CQJ8 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ndufb9Q9CQJ8 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ndufb9Q9CQJ8 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ndufb9Q9CQJ8 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ndufb9Q9CQJ8 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ndufb9Q9CQJ8 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ndufb9Q9CQJ8 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ndufb9Q9CQJ8 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ndufb9Q9CQJ8 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ndufb9Q9CQJ8 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ndufb9Q9CQJ8 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ndufb9Q9CQJ8 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ndufb9Q9CQJ8 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ndufb9Q9CQJ8 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ndufb9Q9CQJ8 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ndufb9Q9CQJ8 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ndufb9Q9CQJ8 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ndufb9Q9CQJ8 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ndufb9Q9CQJ8 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ndufb9Q9CQJ8 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ndufb9Q9CQJ8 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ndufb9Q9CQJ8 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ndufb9Q9CQJ8 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ndufb9Q9CQJ8 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ndufb9Q9CQJ8 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ndufb9Q9CQJ8 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ndufb9Q9CQJ8 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ndufb9Q9CQJ8 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ndufb9Q9CQJ8 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ndufb9Q9CQJ8 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ndufb9Q9CQJ8 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ndufb9Q9CQJ8 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ndufb9Q9CQJ8 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ndufb9Q9CQJ8 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ndufb9Q9CQJ8 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ndufb9Q9CQJ8 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ndufb9Q9CQJ8 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ndufb9Q9CQJ8 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ndufb9Q9CQJ8 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ndufb9Q9CQJ8 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ndufb9Q9CQJ8 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ndufb9Q9CQJ8 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ndufb9Q9CQJ8 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ndufb9Q9CQJ8 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ndufb9Q9CQJ8 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ndufb9Q9CQJ8 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ndufb9Q9CQJ8 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ndufb9Q9CQJ8 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ndufb9Q9CQJ8 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ndufb9Q9CQJ8 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ndufb9Q9CQJ8 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ndufb9Q9CQJ8 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ndufb9Q9CQJ8 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ndufb9Q9CQJ8 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ndufb9Q9CQJ8 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ndufb9Q9CQJ8 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ndufb9Q9CQJ8 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ndufb9Q9CQJ8 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ndufb9Q9CQJ8 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ndufb9Q9CQJ8 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ndufb9Q9CQJ8 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ndufb9Q9CQJ8 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ndufb9Q9CQJ8 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ndufb9Q9CQJ8 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ndufb9Q9CQJ8 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ndufb9Q9CQJ8 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ndufb9Q9CQJ8 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ndufb9Q9CQJ8 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ndufb9Q9CQJ8 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ndufb9Q9CQJ8 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ndufb9Q9CQJ8 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Ndufb9Q9CQJ8 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ndufb9Q9CQJ8 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ndufb9Q9CQJ8 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ndufb9Q9CQJ8 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ndufb9Q9CQJ8 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ndufb9Q9CQJ8 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ndufb9Q9CQJ8 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ndufb9Q9CQJ8 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ndufb9Q9CQJ8 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ndufb9Q9CQJ8 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ndufb9Q9CQJ8 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ndufb9Q9CQJ8 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ndufb9Q9CQJ8 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ndufb9Q9CQJ8 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms